فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

به منظور آنالیز تنوع ژنتیکی موجود در خزانه محلی ژرم پلاسم نیشکر استان خوزستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD تعداد 48 ژنوتیپ‌ از این خزانه تهیه شد. استخراج DNA از برگ‌ها، با استفاده از روش SDS پتاسیم استات انجام گردید و کیفیت و کمیت آن به ترتیب با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز 1 درصد واسپکتوفتومتر (UV-Vis Camspec M350 Spectrophotometer) ارزیابی شد. در ادامه چرخه های PCR بر اساس نوع آغازگر تعیین شدند. 20 پرایمر در این مرحله مورد استفاده قرار گرفت. آنالیز آماری داده‌های حاصل با استفاده از نرم افزار NTSYS 2.10انجام گرفت. برای تعیین میزان تشابه بین جمعیت ها، از ضریب جاکارد استفاده شد و با استفاده از الگوریتم UPGMA یک دندروگرام بر مبنای ماتریس تشابه تهیه شد. با انجام PCR تعداد 54 قطعه DNA تکثیر شده قابل ارزیابی در نمونه‌ها بدست آمد که 53 باند، معادل 98 درصد باندها چند شکل بودند. بیشترین تعداد باند مربوط به پرایمرهای OPM16 با 5 باند و OPm17 ، OPM36، OPM24 و OPA02 با 4 باند بود. همه پرایمرها به جزء پرایمرOPM27 صددرصد پلی مورفیسم را نشان دادند که بیانگر تنوع بالای نمونههای نیشکر میباشد. بر اساس تجزیه کلاستر و قطع دندروگرام در ضریب تشابه (59%) ژنوتیپهای نیشکر به پنج بخش تقسیم گردیدند. که از این پنج بخش، چهار بخش تنها شامل یک ژنوتیپ بودند و 45 ژنوتیپ دیگر در یک گروه قرار گرفتند. از این رو نتایج بدست آمده به انتخاب والدین با فاصله ژنتیکی بیشتر جهت تلاقی‌های موفق‌تر و دست‌یافتن به تنوع ژنتیکی بالاتر کمک خواهد نمود.