بررسی چند شکلی DNA در جمعیتهای AG-4 Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP
نویسندگان
1 دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
2 استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران
3 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.
doi
چکیده
توالیهای DNA ریبوزومی بهدلیل اینکه دارای کپیهای زیادی از ژنهای rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر میباشند، بهمنظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار میگیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هستهای، واحدهای تکراری تکامل یافته ثابت میباشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. بهمنظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژنهای s28 و s18 در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani گروه آناستوموزی 4 (AG-4)، 28جدایه از میزبانهای مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایهها DNA استخراج و از آنها به عنوان الگو در واکنشهای PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصلهساز داخلی بین ژنهای ریبوزومی با استفاده از آغازگرهای ITS1 و ITS4 یک قطعه DNA به اندازه 700 جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیمهای برشیTaq I Xba I, Hae III, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I, Hinc II, Hinf I, Eco RI, هضم شد. ولی آنزیمهای Xba I, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایههای Rhizoctonia solani AG4 هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروههای AG4-HG I و AG4-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.