معرفی روش ساده و آسان برای استخراج DNA ژنومی در قارچهای رشتهای
نویسندگان
1 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد مرودشت، دانشگاه آزاد اسلامی، مرودشت، ایران.
2 استادیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد مرودشت، دانشگاه آزاد اسلامی، مرودشت، ایران.
3 استادیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد مرودشت، دانشگاه آزاد اسلامی، مرودشت، ایران
doi
چکیده
امروزه روشهای مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات میباشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج DNA میباشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیکهای معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج DNA قارچهای رشتهای مورد استفاده قرار میگیرد شامل C-TAB، فنل کلروفرم و کیتهای آزمایشگاهی استخراج DNA میباشد که هر کدام مزایا و معایب خاص خود را دارند، در این مقاله روشی جهت استخراج DNA از قارچهای رشتهای پادزیست، گندرو و بیماریزای گیاهی معرفی میگردد که تلفیقی از روشهای مذکور به منظور تسهیل و عدم استفاده از ازت مایع و فنل جهت استخراج DNA میباشد که در مورد مخمرها نیز استفاده می شود. این روش، روش خرد کردن با گریندر نام دارد که ایمنتر، کم هزینهتر و سریعتر بوده و DNA حاصله از درجه خلوص نسبتا بالایی برخوردار است. خلوص و کیفیتDNA استخراج شده توسط این روش به کمک اسپکتروفتومتر بررسی گردید و به کمک آغازگرهای اختصاصی و PCR، ناحیهی ITS از DNA ریبوزومی و ژن β-tubulin در DNA استخراج شده، تکثیر گردید. با توجه به نتایج به دست آمده از اسپکتروفتومتر و کیفیت باندهای حاصل از محصول PCR در ژل آگاروز، میتوان این روش را بهعنوان یک روش عملی و مناسب جهت استخراج DNA قارچهای رشته ای بکار برد.