مدل سازی رشته های کوتاه پلی پپتیدی برای شناسایی آمینواسیدهای ضروری از طریق محاسبه طیف تشدید مغناطیسی هسته
نویسندگان
1 گروه مهندسی پزشکی دانشگاه صنعتی همدان
2 گروه آموزشی مهندسی برق، دانشگاه صنعتی همدان، همدان، ایران
3 گروه مهندسی برق- دانشکده مهندسی برق- دانشگاه صنعتی همدان- همدان- ایران
doi
10.22075/jme.2021.22093.2013چکیده
پروتئینها به دلیل آنکه نشانگر زیستی بیماریهای خاصی هستند از اهمیت ویژهای برخوردارند بهنحویکه کاهش یا افزایش آنها در بدن میتواند نشانه بیماری باشد. این پژوهش بهمنظور بررسی و شناسایی رشتههای پروتئینی کوچک از طریق محاسبه طیف تشدید مغناطیسی هسته انجامشده است. آمینواسیدها واحدهای سازنده پروتئین در بدن هستند و آمینواسیدهای ضروری به آمینواسیدهایی گفته میشود که توسط بدن تولید نمیشوند و باید از طریق زنجیره غذایی به بدن برسند. ازآنجاییکه آمینواسیدهای ضروری برای فرآیندهای حیاتی ازجمله ساخت پروتئینها و سنتز هورمونها مورد نیاز هستند، از اهمیت بالایی برخوردارند و در این پژوهش مورد مطالعه قرار میگیرند. ابتدا رشتههایی به طول دو تا شش آمینواسید با مونومرهای یکسان با استفاده از نرمافزار Gauss View مدلسازی و طیف تشدید مغناطیسی هسته آنها، با استفاده از نرمافزار Gaussian 09w محاسبهشده است. این ساختارها بهمنظور بررسی عواملی چون نوع و طول رشته آمینواسید، بر دامنه و محل پیک ماکزیمم در طیف تشدید مغناطیسی هسته مدلسازی شدهاند. با تحلیل نتایج حاصل از مدلسازی طیف تشدید مغناطیسی، میتوان دریافت هر آمینواسید طیف تشدید مغناطیسی مخصوص به خود را دارد و نوع آمینواسیدهای موجود در یک زنجیره پلی پپتیدی بر طیف تشدید مغناطیسی آن اثرگذار است. توانایی روش تشدید مغناطیسی هسته در تشخیص و شناسایی انواع بیماریها، ماهیت غیرتهاجمی آن، و همچنین امکان تکرارپذیری آزمایشات، علاوه بر اینکه هزینه های آزمایشات را کاهش میدهد، این روش را به عنوان یکی از روشهای نوین و پیشرفته جهت مطالعه بیماریها تبدیل کرده است.