ارزیابی بیوانفورماتیکی موجودات تراریخته برای پتانسیل آلرژی زایی
نویسندگان
1 گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم وفناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
2 دانشیار گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم وفناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
3 گروه علوم گیاهی و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
4 گروه علوم و زیست فناوری گیاهی، دانشکده علوم وفناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
doi
چکیده
یکی از مراحل ارزیابی ایمنی محصولات تراریخته پتانسیل آلرژی زا بودن آن است. بدین منظور بررسی آلرژیزا بودن پروتئینهای تولید شده توسط این محصولات با استفاده از تجزیه و تحلیلهای بیوانفورماتیکی، امری ضروری تلقی میشود. در این مطالعه برای ارزیابی بیوانفورماتیکی شش پروتئین مهم محصولات تراریخته از سه پایگاه داده آلرژنها ( Allergenonlineو SDAP وAllermatch ) استفاده شد. توالیهای ورودی محصولات برای بررسی مشابهت با توالی کامل و آمینواسیدهای 80 تایی با شباهت بیشتر از 50 و 35 درصد بترتیب در پایگاه داده آلرژن مورد بررسی قرار گرفتند. از بین پروتئینهای مورد مطالعه، کیتیناز و PRP که مصرف انسانی دارند شباهت بالایی با پروتئینهای آلرژن نشان دادند. این پروتئینها منشا گیاهی داشته و بطور طبیعی آلرژن محسوب می شوند. درحالی که پروتئین هورمون رشد (Growth Hormone-1)، Cry1AC (پروتئین کریستال دفع آفات)، CspB (پروتئین تحمل به خشکی ) و(Rpi-vnt1.2) شباهتی با پروتئینهای آلرژن نشان ندادند. نتایج به دست آمده نشان میدهد که ارزیابی آلرژیزا بودن و آنالیزهای بیشتر (بررسی کل پروتئین ها) قبل از تجاری سازی این محصولات لازم است تا ایمنی محصولات تراریخته تایید شود.