بررسی بیوانفورماتیکی ازجمله داکینگ مولکولی و غربالگری مجازی مبتنی بر ساختار بر روی ریزمولکولها با منشأ گیاهی برای درمان بیماری کووید- 19
نویسندگان
1 گروه زیست شناسی سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
2 گروه ویروس شناسی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
3 گروه نانوبیوتکنولوژی، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران
4 گروه زیست شناسی سلولی مولکولی، دانشکده علوم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران
doi
10.32598/JSMJ.21.6.2372چکیده
زمینه و هدف امروزه با وجود تحقیقات بسیاری که د رمورد ویروس کرونا صورت گرفته است، اما هنوز هم شاهد نرخ مر گ ومیر بالای اینبیماری هستی؛ که باعث شده است محققان تمرکز بیشتری روی شناسایی داروهای ض دویروسی کارآمد از بین داروهای موجود داشتهباشند. در این میان، استفاده از ری زمولکو لهایی با منشأ گیاهی به دلیل ایمنی بالات ر، سمیت کمتر و مقرو نب هصرفه بودن مورد توجه قرارگرفته است. ما در این مطالعه با استفاده ازداکینگ مولکولی، به شناسایی بازدارند ههای پروتئین 3cl protease و ACE-2 به دلیل اهمیتآ نها در بیمار یزایی ویروس کرونا پرداخت هایم.روش بررسی بدی نمنظور، 1600 ترکیب با منشأ طبیعی با استفاده از یک غربالگری مجازی بررسی گرفتند. در این روش لیگاندهاییبا تمایل بالا نسبت به رزیدوهای جایگاه فعال پروتئی نهای هدف با استفاده از گلاید داکینگ شناسایی شدند تا برای محاسبات بیشترب راساس روش القای قالب با استفاده از نر مافزار شرودینگر مورد تجزی ه وتحلیل قرار بگیرند.یافت هها یافت هها نشان م یدهند ترکیبات ب هدس تآمده ازجمله Delphinidin و Theaflavin با دارا بودن میل اتصال بالا به گیرند ههایمذکور م یتوانند در مهار ویروس کرونا مؤثر باشند. همچنین ترکیبات معرف یشده در مقایسه با داروهای شناخت هشده نظیر کلروکوئین،دارای انرژی اتصال بهتر و اثر مها رکنندگی قاب لتوجهی هستند.نتیج هگیری داد ههای ارائ هشده در این مقاله م یتوانند برای پیشرفت بیشتر در کشف دارو یا فرمولاسیو نهای جدید برای مقابله با ویروسکرونا کم ککننده باشند، اما به آزمای شهای بالینی نیاز است تا پتانسیل مولکو لهای کوچک موردنظر را ب هتنهایی یا ب هصورت ترکیبیبرای کاربردهای پزشکی بررسی کند