بررسی بیوانفورماتیک نقش miRNAها در تنظیم بیان ژن‌های دخیل در بلوغ جنسی و تولیدمثل در ماهی گورخری (Danio rerio)

نویسندگان

1 گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیا بهبهان، بهبهان، ایران.

2 گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه صنعتی خاتم الانبیا، بهبهان، ایران.

3 گروه مهندسی منابع طبیعی و محیط‌زیست، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران.

doi
چکیده

MicroRNA ها (miRNAs) به‌عنوان تنظیم‌کننده ­های حیاتی بیان ژن شناخته می­ شوند و تأثیر به‌سزایی بر فرآیندهای مختلف زیستی از جمله بلوغ جنسی و تولید مثل دارند. در این مطالعه، از ابزارها و تکنیک­ های بیوانفورماتیک برای بررسی نقش miRNA ها در تنظیم بیان ژن­ های مرتبط با بلوغ جنسی و تولید مثل ( ghrhra، kiss2، dnd، gh1، sox9a، shbg، fshb، stat3، cyp17a1، cyp19a1b، ar، amh، esr2b، rspo1 و sox21a) در ماهی گورخر (Danio rerio) استفاده شده است. در این روش با ادغام پیش‌بینی‌های محاسباتی با داده‌های اعتبارسنجی تجربی، شبکه‌های تنظیمی ژن miRNA خاص شناسایی گردید (dre-miR-429a، dre-miR-92a، dre-miR-200b، dre-miR-96، dre-miR-217، dre-miR-155، dre-miR-26a-5p، dre-miR-737، dre-miR-740، dre-miR-737-5p، dre-miR-93، dre-miR-140-3p، dre-miR-15a و dre-miR-144) که در مراحل کلیدی رشد و فرآیندهای فیزیولوژیکی مربوط به بلوغ جنسی و تولیدمثل در ماهی گورخری نقش دارند. یافته‌های این مطالعه، بر مکانیسم‌های نظارتی پیچیده‌ای را که توسط miRNA‌ها در تعدیل بیان ژن‌های حیاتی برای موفقیت باروری در گورخرماهی تنظیم شده‌اند، تأکید می‌کند و بینش‌های ارزشمندی را در مورد اساس مولکولی زیست‌شناسی تولیدمثل در این ارگانیسم مدل ارائه می‌دهد. این مطالعه می­ تواند به درک عمیق‌تری از شبکه‌های نظارتی حاکم بر بلوغ و تولیدمثل جنسی ماهی ­ها کمک ‌کند.