فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

بهبود بازده خوراک در پرورش جوجه‌های گوشتی از اهمیت اقتصادی بالایی برخوردار است. در این پژوهش، داده‌های ترانسکریپتومی روده جوجه‌های گوشتی نر با بازده خوراک بالا (HFE) و پایین (LFE)، حاصل از دو پلتفرم ریزآرایه و RNA-Seq، به‌صورت ادغامی در سطح داده‌های خام تحلیل شدند. پژوهش حاضر با هدف شناسایی ژن‌ها، miRNAهای تنظیم‌کننده و مسیرهای مشترک مرتبط با بازده خوراک از راه یکپارچه‌سازی داده‌ها بر مبنای متغیر فنوتیپی بازده خوراک انجام شد. تحلیل داده‌ها در محیط R انجام شد و ژن‌های با بیان متفاوت با استفاده از بسته limma و بر اساس معیارهای |logFC| ≥ 1.5 و 05/0>P انتخاب شدند. تحلیل شبکه ژنی، ژن‌های RPL15، RPS24، COX7C، NDUFS6، SDHB، ATP5PD و NDUFAB1 را به‌عنوان ژن‌های هاب معرفی کرد که عمدتاً در مسیرهای فسفریلاسیون اکسیداتیو، چرخه اسید سیتریک و سوخت و ساز انرژی نقش دارند. همچنین، gga-let-7g-3p به‌عنوان miRNA تنظیم‌کننده برتر شناسایی شد. این نتایج، نقش هماهنگ سوخت و ساز انرژی و تنظیم بیان ژن در تعیین بازده خوراک روده طیور را برجسته کرده و مبنایی برای توسعه نشانگرهای مولکولی کاربردی فراهم می‌سازد.