تحلیل پیشبینی تعاملاتmiRNA با ژنهای ریبوزومی RPS28 و RPL31 و نقش آنها در پاسخ ایمنی ماکیان به عفونت ویروس آنفلوآنزا
نویسندگان
1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاروزی، دانشگاه صنعتی اصفهان
2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج
doi
10.22124/ar.2025.31279.1912چکیده
ریزRNAها (miRNAها) مولکولهای RNA کوچک نارمزگر هستند که با طول تقریبی برابر با 18 تا 25 نوکلئوتید از راه جفت شدن با توالیهای مکمل در mRNA هدف، پایداری آن و ترجمه ژنها را در سطح پسارونویسی تنظیم میکنند. این مولکولها، نقش مهمی در فرآیندهای زیستی گوناگون از جمله رشد، تمایز سلولی، سوخت و ساز، مرگ برنامهریزیشده سلول و همچنین، بیماریهای گوناگونی همچون سرطان و بیماریهای عفونی دارند. در ماکیان، miRNAها نهتنها در رشد و سوخت و ساز بلکه بهویژه در تنظیم پاسخ ایمنی و مقاومت در برابر عوامل بیماریزایی مانند ویروس آنفلوآنزا تأثیرگذارند، بهطوری که تغییرات بیان آنها میتواند بهعنوان بخشی از سازوکار دفاعی میزبان عمل کند یا بهوسیله ویروس برای تسهیل فرآیند عفونت دستکاری شود. هدف این تحقیق، شناسایی و تحلیل miRNAهای کلیدی مرتبط با پاسخ ایمنی طیور به عفونت آنفلوآنزا و همچنین، بررسی تعامل آنها با دو ژن اساسی ریبوزومی، RPS28 و RPL31، بود. این دو ژن از یک پژوهش دیگر استخراج شده بودند که دادههای ریزآرایه DNA مربوط به عفونت آنفلوآنزای ماکیان (GSE96837) را از پایگاه GEO/NCBI بهدست آورده و با استفاده از تحلیل شبکه همبیانی ژنها، شناسایی کرده بودند. سپس، تعاملات miRNA–mRNA با استفاده از ابزار جامع tools4miRs.org و با چندین الگوریتم مختلف (شامل TargetSpy، Miranda و RNAhybrid ) پیشبینی شد. نتایج نشان داد miRNAهایی چون gga-mir-214، gga-mir-194، gga-mir-7477-5p و gga-mir-6642-3p با توجه به تعداد جایگاههای اتصال و تأیید چندین ابزار مستقل، از پتانسیل بالایی در تنظیم مسیرهای مرتبط با آپوپتوز، تنظیم سیتوکاینها و کنترل ایمنی ضدویروسی برخوردار هستند.