مطالعه شباهت های ژنتیکی و تجزیه و تحلیل تبارشناختی شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایرانی با هفت گونه اصلی موجود در خانواده شترسانان بر اساس ژنوم میتوکندریایی
نویسندگان
1 واحد ژنتیک و اصلاح نژاد حیوانات (AGBU)، دانشگاه نیوانگلند، آرمیدال، استرالیا
2 مرکز تحقیقات ابریشم کشور، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، گیلان، ایران
3 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا
4 گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا
5 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا
doi
10.22124/ar.2025.30642.1895چکیده
توالیهای ژنوم کامل میتوکندریایی هفت گونه اصلی شترسانان شامل Vicugna vicugna، Lama guanicoe، Vicugna pacos، Lama glama، Camelus ferus، Camelus dromedarius، Camelus bactrianus، چهار شتر تک کوهانه و شش شتر دوکوهانه ایرانی همراه با توالیهای ۱۳ ژن رمزگر (PCGs) بهازای هر ژنوم از سایت NCBI استخراج شدند. همچنین، مجموعهای از 3100 چندشکلی تک نوکلئوتیدی (SNP) از توالیهای کامل گونههای مورد بررسی تهیه شد که پس از فیلتراسیون، برای ساخت ماتریس روابط ژنومی مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج ترسیم درختهای تبارشناختی بر اساس توالیهای کامل، دو خوشه اصلی همراه با چند زیر خوشه را نشان داد، بهشکلی که گونههای Vicugna vicugna، Lama guanicoe، Vicugna pacos، Lama glama و Camelus ferus، یک شاخه اصلی و باقی گونههای تک کوهانه (Camelus dromedarius) و دوکوهانه (Camelus bactrianus) همراه با Camelus ferus، یک زیر شاخه اصلی دیگر با چند زیر شاخه تشکیل دادند. درصد تشابه ژنتیکی بین هفت گونه اصلی و گونههای ایرانی بین 4/82 تا 100 درصد متغیر بود. توالیهای نوکلئوتیدی و آمینواسیدی ژنهای رمزگر، خوشهبندی مشابه با توالیهای کامل نشان دادند. ژن ATP8، بیشترین و ژن COX1، کمترین تنوع ژنتیکی را داشتند. ترسیم نقشه حرارتی و نمودار PCA مبتنی بر دادههای SNP و نمودار سطحی شباهتهای نوکلئوتیدی، نتایج مشابهی داشت. یافتههای این مطالعه نشان داد که مقایسه توالیهای ژنوم میتوکندریایی میتواند گونههای اصلی خانواده شترسانان را بهصورت قوی طبقهبندی کند و روابط تکاملی آنها را روشن سازد. این تحقیق، بینشهای ارزشمندی برای مطالعات آینده در زمینه ژنتیک و تکامل شترسانان فراهم میکند.