مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش با استفاده از نشانگرهای مولکولی

نویسندگان

1 استادیار، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

2 استادیار، گروه علوم دامی، واحد مهاباد، دانشگاه آزاد اسلامی

doi
10.22124/ar.2022.21249.1671
چکیده

در این تحقیق جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش، تعداد 75 نمونه خون از محل پراکنش این حیوانات جمع­آوری شد. استخراج DNA با روش بهینه یافته Salting-Out انجام گرفت. تعداد 10 جایگاه ریزماهواره و یک ناحیه کنترلی D-Loop مربوط به DNA میتوکندریایی (mtDNA) مورد مطالعه قرار گرفت. برای تکثیر جایگاه­های ریزماهواره از یک PCR چندگانه استفاده شد. آغازگرهای انتخابی نشان­دار شده و  با استفاده از دستگاه Genetic Analyser تعیین ژنوتیپ افراد انجام گرفت. در مجموع، 84 آلل در جمعیت مورد مطالعه شناسایی شد، لذا متوسط تعداد آلل به ازای هر نشانگر برابر با 4/8 بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و هتروزیگوسیتی مشاهده شده در این جمعیت به ترتیب برابر با 042/0±724/0 و 058/0±80/0 بود. مقدار FIS در این جمعیت برابر با  108/0-  بود که نشان­دهنده غیرهمخون بودن و وجود تنوع قابل توجه در این جمعیت است. نتایج حاصل از ناحیه کنترلی mtDNA نشان داد که میزان تنوع هاپلوتیپی و درصد جایگاه­های چندشکل در این جمعیت به ترتیب 039/0±938/0 و 59/4 است. از مجموع 24 نمونه تعیین توالی شده در ناحیه کنترلی mtDNA، تعداد 17 هاپلوتیپ در جمعیت مورد مطالعه مشخص شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی در جمعیت شین بش، 0013/0±0131/0 به ازای هر جایگاه به­دست آمد. نتایج این تحقیق نشان داد که 50 درصد از افراد جمعیت شین بش دارای هاپلوگروه A، 2/29 درصد افراد دارای هاپلوگروه B و 8/20 درصد افراد دارای هاپلوگروه C هستند.