شناسایی متابولیت های گیاهی موثر بر مهار پروتئاز ویروسHTLV-1 با رویکرد آنالیز شبکه

نویسندگان

1

2 دانشگاه بیرجند

3 دانشگاه تهران

doi
10.22051/jab.2024.45009.1591
چکیده

مقدمه: ویروس 1-HTLV اولین رتروویروس انسانی کشف شده است که در حال حاضر هیچ درمان یا واکسن قطعی برای آن وجود ندارد. درمان ضد رتروویروسی چرخه تکثیر ویروس را مختل کرده و سرعت تکثیر عفونت را کاهش می‌دهد اما مخازن ویروسی را از بین نمی‌برد. به دلیل موفقیت مهارکننده های پروتئاز1-HIV در مهار ویروس، پروتئاز1-HTLV نیز یک هدف مهم برای اختلال در عملکرد ویروس شناخته شده است.مواد و روش ها: ابتدا به روش داده کاوی، بانک اطلاعاتی گیاهان موثر در مهار پروتئاز ویروس 1-HTLV و 1-HIV تهیه شد. سپس به منظور شناسایی متابولیت های کلیدی، شبکه دوجزئی گیاه-متابولیت با نرم افزار cytoscape ترسیم شد. در ادامه شبکه با استفاده از افزونه های Network Analyzer و Cytohubba آنالیز شد تا متابولیت های کلیدی در مهار پروتئاز ویروس شناسایی شود.نتایج و بحث آنالیز شبکه با استفاده از 8 پارامتر مختلف منجر به شناسایی و معرفی 77 متابولیت بالقوه موثر بر مهار پروتئاز ویروس 1-HTLV از میان 20046 متابولیت در 990 گیاه معرفی شده به روش داده کاوی شد. نتایج نشان داد این ترکیبات از مشتقات کافئیک اسید، کوئرستین، تیرامین، و جیبرلین و ... هستند و می‌توانند ترکیبات بالقوه‌ای برای مهار پروتئازهای ویروسی باشند. یافته های مطالعه حاضر گروه های مختلف ترکیبات گیاهی را معرفی کرد که می‌تواند برای طراحی دارو‌های پایه گیاهی موثر بر مهار و مبارزه با عفونت‌های ویروسی 1-HTLV مورد استفاده قرار گیرد.