فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

با توسعه فن آوری‌های تعیین توالی با توان بالا، داده‌های توالی با سرعت زیادی جمع‌آوری می‌شوند و تفسیر عملکرد آنها یک چالش اساسی است. ژنATXN2 کد کننده پروتئینی با عملکرد ناشناخته در برنج (oryza sativa) است. هدف از این مطالعه، تعیین ساختار دمین و پیش‌بینی عملکرد این پروتئین بود. از این رو درخت فیلوژنی موتیف توالی با 164 توالی اسید آمینه ATAXIN-2 از 45 گونه گیاهی توسط مجموعه MEME و نرم افزار Phylip آنالیز شد. نتایج، دو نوع کلی کلاس از پروتئین‌های ATAXIN-2 را مشخص نمود. عدم وجود دمین LsmAD در یک کلاس ممکن است ویژگی‌های عملکردی متمایزی را نسبت به کلاس دیگر ATAXIN-2 اعطا کند. در این پژوهش عملکرد ATAXIN-2 به عنوان پروتئین‌های متصل شونده به RNA (RNA binding) پیش‌بینی شد که در تنظیم mRNA سیتوپلاسمی در جنین‌زایی برنج نقش دارد. یافته‌های این پژوهش می‌تواند اساس تحقیق در مورد عملکرد این پروتئین در هدف قرار دادن زیرمجموعه‌های جداگانه mRNA به مکان‌های زیر سلول در گیاهان باشد که توسط سلول‌های دو قطبی جنین برای ایجاد محفظه‌های عملکردی مشخص بکار گرفته می‌شود.