تجزیه و تحلیل اثرات تنظیمی lncRNAها بر بافت کلیه در جوجههای گوشتی مبتلا به سندروم آسیت
نویسندگان
1 گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد ، ایران
2 گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد ، ایران
3 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز ، ایران
4 گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران.
doi
10.22067/ijasr.2023.83528.1162چکیده
آسیت یک اختلال متابولیکی مهم در صنعت طیور تجاری میباشد که بافتهای متفاوتی از جمله کلیه را درگیر میکند. در این پژوهش، ژنهای غیررمزکننده بلند(lncRNA) مؤثر در بیماری آسیت در جوجههای گوشتی که اثر تنظیمی روی ژنهای mRNA هدف دارند با استفاده از فناوری RNA-seq مورد بررسی قرار گرفت. در روز 39 آزمایش، از بافت کلیه، چهار نمونه سالم و چهار نمونه بیمار RNAکل استخراج و با استفاده از پلتفرم illumina Hiseq2500 توالییابی انجام شد. بر اساس نتایج آنالیز RNA-seq، تعداد 1421 رونوشت lncRNA از 921 جایگاه ژنی شناسایی شد که با 154 ژن رمزشونده در محدوده 100 هزار باز بالادست و پاییندست ژنهای مورد نظر ارتباط داشتند. از میان جفت ژنهای رمزشونده و lncRNA، آنهایی که همبستگی بیانی بیشتر از مثبت 90 درصد و کمتر از منفی 90 درصد داشتند، بهترتیب بهعنوان جفت ژنهای با بیان همراستا و غیر همراستا مورد ارزیابی قرار گرفتند. بررسی عملکردی این ژنها نشان داد که 13 ژن بهطور معنیداری در مسیرهای متعدد زیستی مرتبط با بیماری مشاهده شدند. با هدف قراردادن مسیرهای مهم زیستی بهدست آمده و ژنهای مؤثر بر آنها شامل C1GALT1C1، PLCD4، GCNT4، DGKA، IMPA2، GBA2، CERS5، CDH1، CSF1، CTNND1، LPAR2، DAO، PIPOX و تمرکز بر نقش آنها در پیشگیری و درمان بیماری آسیت، درک بهتری از عملکرد آنها را در تأمین انرژی و حفظ هموستاز کلیه، ممکن ساخته تا جهت پیشگیری و درمان بیماری آسیت، بینشی جدید برای اصلاح نژاد و کاهش مشکلات مربوط به این بیماری در گلههای تجاری ارائه دهد.