تجزیه و تحلیل بیان ژن‌های کاندیدا در بخش‌های سفید و تیره بافت پوست در گوسفند لری بختیاری

نویسندگان

1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

3 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران

doi
10.22067/ijasr.2023.83699.1166
چکیده

در گوسفندان نژاد لری بختیاری، وجود لکه‌های سیاه بر روی پوست منجر به کاهش کیفیت پشم استحصالی می‌شود. اساس مولکولی و ژن­های دخیل در رنگ پوشش برخی از دام­ها از جمله گوسفندان تا حدودی شناسایی شده است. از این رو، هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیان ژن­های گیرنده ملانوکورتین-1 (MC1R)، پروتئین سیگنال­دهی آگوتی (ASIP)، فاکتور شبه­کروپل4 (KLF4)، و فاکتور رونویسی القاکننده ملانوسیت ((MITF در بخش­های سفید و تیره بافت پوست در گوسفندان نژاد لری ‌بختیاری بود. برای این منظور، از تعداد 14 رأس گوسفند با رنگ پوشش سفید دارای لکه‌های تیره (سیاه)، نمونه پوست از هر دو بخش سفید و تیره تهیه و RNA کل استخراج گردید. برای ارزیابی بیان نسبی ژن‌های مورد نظر، از ژن‌های β-actin و GAPDH به‌عنوان ژن مرجع جهت نرمال کردن داده­ها استفاده گردید. همچنین، جهت تکثیر قطعه­ای از ژن­های مورد مطالعه، با استفاده از توالی mRNA موجود برای این ژن­ها در بانک اطلاعاتی (GenBank)، آغازگرهای مناسب توسط نرم‌افزار Primer3plus طراحی شدند. در نهایت، از نرم‌افزارهای BestKeeper و REST 2009 V2.0.13 برای تجزیه و تحلیل داده‌های بیان ژن استفاده شد. بر اساس نتایج توصیفی، ژن‌های MC1R وMITF با میانگین 42/30 و 86/25 برای مقادیر Ct، به‌ترتیب کمترین و بیشترین مقدار بیان را در بین ژن‌های هدف در نمونه‌های پوستی داشتند. علاوه‌براین، ژن‌های مرجع (β-actin و GAPDH) بیشترین پایداری بیان را در بین تمام ژن‌های مورد مطالعه داشتند. تفاوت معنی‌داری در سطوح mRNA ژن‌های MC1R، ASIP، KLF4 و MITF در بافت تیره پوست نسبت به بخش سفید پوست مشاهده نشد. اگرچه، بیان ژن ASIP در قسمت تیره نسبت به بخش سفید پوست بیش از دو برابر بود، امّا این تفاوت ازنظر آماری معنی­دار نبود. علاوه‌براین، ژن‌ MC1R کمترین تفاوت بیان را در بخش‌های سیاه و سفید بافت پوست از خود نشان داد. این نتایج نشان می دهد که سطح بیان این چهار ژن مورد مطالعه نقشی در ایجاد لکه‌های پوستی سیاه رنگ در گوسفند نژاد لری بختیاری نداشته باشد.