مقایسه ماتریسهای روابط خویشاوندی ژنومی متفاوت در پویش ژنومی وزندهی شده چند جمعیتی
نویسندگان
1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
doi
10.22067/ijasr.2023.79619.1108چکیده
هدف از پژوهش حاضر، انتخاب بهترین ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی برای پویش ژنومی چندجمعیتی است. ساختار ژنتیکی جمعیتها منحصر به فرد هستند، بنابراین برای تشکیل ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی چند جمعیتی از ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی شده استفاده میشود. در این مطالعه، ابتدا دو جمعیت با ساختار ژنتیکی متفاوت شبیهسازی شدند. سپس ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی معمولی (G)، ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی شده (BG) و ماتریس روابط خویشاوندی ژنومی بلوکبندی وزندهی شده با واریانس ژنوتیپی برآورد شده با بیز B (WBG) برای حیوانات تشکیل شدند و برای مطالعات پویش ژنومی تک مرحلهای استفاده شدند. علاوهبر آن، با روش بیزB پویش ژنومی انجام شد و با پویشهای ژنومی تک مرحلهای مقایسه شدند. نتایج پویش ژنومی با استفاده از ماتریسهای روابط خویشاوندی G، BG و WBG نشان داد که بهطور میانگین بهترتیب 14، 16، 21 نشانگر ژنومی مرتبط با QTLهای صفات شناسایی شدند که واریانس ژنتیکی توجیه شده بالای یک درصد دارند. همچنین با استفاده از روش آماری بیز B تنها دو نشانگر ژنومی با واریانس بالای یک درصد شناسایی شدند. علاوهبراین، میانگین صحتهای پیشبینی ارزش اصلاحی ژنومی در لحظه همگرایی با استفاده از ماتریسهای G، BG و WBG بهترتیب 36/0، 39/0، 43/0 برآورد شدند. نتیجه گیری کلی نشانداد که استفاده از ماتریسهای روابط خویشاوندی ژنومی BG و WBG میتواند باعث بهبود پویش ژنومی چندجمعیتی یا چندنژادی شود.