فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

توکوفرول­ها (ویتامین E)، گروهی از ترکیبات آلی هستند که فعالیت‌های حیاتی را در سلول‌های گیاهی فراهم می‌کنند؛ دستگاه فتوسنتزی را از خسارت اکسیداتیو نوری در امان نگه می‌دارند و باعث حفاظت غشای کلروپلاست از پروکسیداسیون لیپید می‌شوند؛ همچنین وجود آن‌ها در تغذیه انسانی ضروری است. در این تحقیق، شش ژن‌ دخیل در بیوسنتز توکوفرول­ها شامل HPPD/PDS1، VTE5، HPT/VTE2، VTE3/APG1/IE35، TC/VTE1، γ-TMT/VTE4 و فراورده‌های این ژن‌ها به کمک پایگاه­های اطلاعاتی و نرم‌افزارهای بیوانفورماتیک، به‌صورت In Silico در گیاه عدس شناسایی شدند که می‌توان پس از شناسایی و جداسازی ژن‌ها، آن‌ها را برای اهداف اصلاحی عدس از طریق بهنژادی سنتی یا روش‌های نوین زیست فناوری به‌کار برد ترسیم درخت فیلوژنتیکی با برنامه MEGA 7 نشان داد که اکثر این ژن‌ها در گیاه عدس با گیاهان هم‌خانواده خود مانند نخود و یونجه هومولوژی بالایی دارند. پیش‌بینی حضور دمین‌های حفاظت‌شده مشخص کرد که پروتئین HPPD دارای دو دمین و یک زیردمین و پروتئین­های γ-TMT و VTE3 هر کدام دارای یک دمین حفاظت‌شده می‌باشند. نتایج حاصل از توصیف پروتئین‌ها با استفاده از ابزار ProtParam تعیین کرد که بالاترین فراوانی از نظر ترکیب اسیدهای آمینه، به لوسین، سرین و گلایسین و کمترین فراوانی، به دو اسیدآمینه سلنوسیستئین و پیرولیزین تعلق داشت. با استفاده از برنامه DeepLoc-1.0 پیش‌بینی شد که به­غیر از پروتئین HPPD که محلول در سیتوپلاسم است، پنج پروتئین دیگر در فضای بین دو غشا پلاستیدها قرار می‌گیرند.