شناسایی و ارزیابی الگوی بیان ژنهای دخیل در مسیرهای سیگنالدهی در آجیلوپس (Aegilops tauschii) تحت تنش شوری
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
2 استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3 گروه سلولهای بنیادی، مرکز تحقیقات علوم سلولی جهاد دانشگاهی، پژوهشگاه رویان، تهران
4 دانشیار، بخش ژنومیکس پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج
5 استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
6 دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه شهید باهنر کرمان
doi
10.22059/ijfcs.2016.58855چکیده
شور شدن زمینهای کشاورزی یکی از مهمترین عاملهای محدودکنندۀ تولیدات کشاورزی و تهدیدکنندۀ امنیت غذایی در کشورهای جهان بهشمار میآید. فعال شدن مسیرهای سیگنالی نخستین رخداد در شناسایی تنشهای محیطی برای گیاهان بهشمار میآید. شناسایی اجزای شبکۀ سیگنالی در پاسخ به تنش شوری با استفاده از روش RNA Seq در گیاه آجیلوپس بهعنوان منشأ ژنگان (ژنوم) DD در گندم، اهمیت زیادی دارد. توالییابی RNA به همراه استفاده از نرمافزار MapMan برای تفسیر عملکردی نتایج بیان ژن روش مناسب برای بررسیهای ژننامه شناسی (ژنومیکس) کارکردی در گیاهان به شمار میآید. لذا در این تحقیق با استفاده از کتابخانۀ تهیهشده از RNA استخراجشده از گیاهان کنترل و تحت تنش، اقدام به شناسایی و ارزیابی کمی ژنهای دخیل در فرآیندهای سیگنالی شد. نتایج بیان ژن نشان داد که از بین 4506 رونوشت دارای تغییر بیان معنیدار، فرآیندهای سیگنالی با 603 عدد BIN (59/11 درصد) بیشترین شمار را به خود اختصاص داد. همچنین مشخص شد که از بین اجزای شبکۀ سیگنالی، گیرندة (رسپتور) کینازها بیشترین شمار (222 عدد BIN) از ژنهای تغییربیانیافته را شامل میشوند که درواقع بیانکنندۀ اهمیت آنها است. این تحقیق بهعنوان یک بررسی بنیادی به شمار میآید که زمینه برای انجام بررسیهای انتقال ژنهای مقاومت به شوری به گیاه گندم را فراهم میکند.