شناسایی قطعات کروموزومی 1RS چاودار در جنس Aegilops با استفاده از نشانگر مولکولی اختصاصی DNA

نویسندگان

1 استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی/دانشکده علوم زراعی و دامی

2 دانشجوی کارشناسی ارشد

doi
10.22059/ijfcs.2012.29046
چکیده

چاودار به عنوان یک منبع ژنتیکی خارجی توسط اصلاح گرها به وفور در افزایش تنوع ژنتیکی گندم استفاده شده است، و کروموزوم 1R و بخصوص بازوی کوتاه آن 1RS به فراوانی به ژنوم گندم انتقال داده شده است. در مطالعات 1RS و انتخاب موثر از تکنیک‌های سیتوژنتیکی، بیوشیمیایی و نشانگرهای DNA استفاده می‌شود. در این مطالعه وجود قطعات کروموزومی چاودار در بعضی از گونه‌های خانواده گندمیان با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی 1RS (RyeR3/F3) بررسی شده است. برای این منظور، از چاودار، گندم نان و تعدادی از گونه‌های جنس Aegilops، DNA ژنومی استخراج و واکنش زنجیره ای پلیمراز با کمک آنزیم TaKaRa Ex TaqTM انجام گرفت. نتایج حاصل از این پژوهش نشان داد که توالی تکثیری مورد انتظار مربوط به رتروترانسپوزون‌های gypsy-like با طول bp1451 در DNA ژنومی گونه‌های چاودار، گندم نان، Ae. biuncialis، Ae. crassa، Ae. cylindrica،Ae. kotschyi ، Ae. speltoides و Ae. taushii بر روی ژل آگارز مشاهده و صحت باندها با کمک داده‌های حاصل از توالی‌یابی تائید گردید. با رسم درخت فیلوژنتیکی، گندم نان و چاودار در یک کلاستر و همچنین Ae. crassa، Ae. taushii، Ae. speltoides، Ae. cylindrica و Ae. biuncialis در کلاستر دیگری قرار گرفتند و Ae. kotschyi بیشترین فاصله ژنتیکی را از گندم و چاودار از نظر توالی رتروترانسپوزونی مورد بررسی داشت. این نتایج نشان می‌دهد که این توالی خاص رتروترانسپوزونی در ژنوم بسیاری از گونه‌های خانواده گندمیان وجود دارد.