مطالعه پاسخ پروتئوم برگ جو در شرایط تنش شوری

نویسندگان

1 دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

2 کارشناسی ارشد مؤسسه تحقیقات دیم سرارود

3 دانشجوی سابق دکتری پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

4 استادیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران

5 دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

doi
چکیده

گیاهان قادرند در پاسخ به تنش‌های محیطی مکانیسم‌های سازگار خود را فعال کنند و با تغییر در بیان ژن‌هایشان به عوامل محیطی واکنش نشان دهند. لذا در همین راستا از تکنیک پروتئومیکس به منظور شناسایی پروتئین‌های پاسخ‌دهنده به تنش شوری در جو لاین 527 استفاده گردید. برای بررسی اثر تنش شوری طولانی مدت بر روی الگوی پروتئوم جو، بذور لاین 527 (تهیه شده از مؤسسه نهال و بذر) در گلخانه تحقیقاتی گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه تهران کشت شدند. اعمال تنش بر روی گیاهان در مرحله 4 برگی، با سطوح صفر (آب معمولی بعنوان شاهد) و 300 میلی‌مولار NaCl صورت گرفت. نمونه‌گیری با جدا کردن برگ چهارم گیاهان در 21 روز بعد از اعمال تنش انجام شد. استخراج پروتئین کل بر اساس روش TCA-استون تغییر یافته انجام شد. پروتئین‌های استخراج شده از برگ جو در بعد اول به وسیله ژل‌های IPG با شیب پی اچ 7-4 جداسازی شدند. در بعد دوم ژل‌های اکریل آمید با غظت 5/12 درصد استفاده شد. نتایج حاصل از آنالیز ژل‌ها نشان داد که از میان بیش از 500 لکه پروتئینی دارای تکرارپذیری، تعداد 124 لکه دارای تفاوت معنی‌دار در بین تیمارها بودند. با استفاده از طیف‌سنج جرمی MALDI-TOF-TOF 21 لکه پروتئینی شناسایی شدند. این پروتئین‌هایی شامل Oxygen-evolving enhancer protein 2، متیونین سولفوکسید ردوکتاز، پروتئین‌های متصل شونده به RNA کلروپلاستی، سیکلوفیلین کلروپلاستی، رابیسکو، فعال‌کننده رابیسکو، Nascent polypeptide associated complex alpha، تیوردوکسین، دهیدرواسکوربات ردوکتاز، شبه جرمین، پروفیلین، پروتئین عمومی تنش و پروتئین‌های ریبوزومی بودند که در مکانیسم‌های فتوسنتز، اکسایش-کاهش، ترجمه، انتقال سیگنال و انتقال پروتئین دخیل هستند.