تشخیص سریع کوی هرپس ویروس (CyHV-3) به روش تکثیر همدما به واسطه حلقه (LAMP) و مقایسه با PCR PCR

نویسندگان

1 استادیار گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

2 استاد گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

3 استاد گروه علوم درمانگاهی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

4 دانشجوی دکتری گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

5 استادیارگروه علوم پایه، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران

6 استاد گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

doi
10.22059/jfisheries.2022.345426.1337
چکیده

هرپس ویروس نوع 3 کپورماهیان (CyHV-3) یا کوی هرپس­ویروس (KHV)، یک ویروس نوظهور به شدت مسری و با حدت بالا است که سبب ایجاد تلفات سنگین و ناگهانی در ماهی کپور معمولی و کوی و هیبریدهای آنها می­شود. روش LAMP یک تکنیک مولکولی مبتنی بر تکثیر بسیار اختصاصی اسید نوکلئیک اجرام پاتوژن در شرایط همدما و بدون نیاز به تجهیزات گران­قیمت می­باشد که در سال‌های اخیر به منظور تشخیص پاتوژن‌های انسان و حیوانات توسعه یافته است. با توجه به اهمیت تشخیص سریع بیماری کوی هرپس­ویروس در مزارع مشکوک به آلودگی و پایش دایمی مزارع پرورش کپورماهیان کشور، این مطالعه با هدف ارزیابی روش تلفیقی LAMP با پروب‌های نانوطلا در تشخیص سریع این ویروس صورت گرفت. در این مطالعه با استفاده از 6 آغازگر اختصاصی، بخشی از ژن تیمیدین کیناز (TK) کوی هرپس­ویروس با روش بهینه شده LAMP، تکثیر و برای تشخیص رقت‌های مختلف DNA ژنومیک و DNA در نمونه­های بافتی کپور معمولی، آزمایش اختصاصیت و حساسیت مورد بررسی قرار گرفت و آزمایش سرعت و حساسیت نسبت به روش PCR معمولی نیز مقایسه گردید. نتایج بیانگر اختصاصی بودن صد درصدی و حساسیت تشخیص بر اساس رقت استوک 8-10 معادل 25/1 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ژنومیک ویروس و 7-10 معادل 2/8 فمتوگرم در میکرولیتر برای DNA ویروسی آمیخته شده در نمونه بافتی بود. همچنین بر اساس نتایج حاصله، روش LAMP پیشنهادی در مقایسه با PCR معمولی سه برابر سریعتر و 8000 برابر دقیق‌تر بود. با توجه به کارایی بالا، روش LAMP می­تواند به عنوان یک ابزار قدرتمند و دقیق و سریع جهت شناسایی مولکولی کوی هرپس­ویروس در آزمایشگاه‌های تشخیصی با تجهیزات اندک مورد استفاده قرار گیرد.