مطالعه فیلوژنی و بیان ژن های پلی آمین اکسیداز (PAO) در ذرت (Zeamays L.)
نویسندگان
1 دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
2 استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
3 دانش آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی،دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران
doi
10.22124/c.2018.7258.1290چکیده
پلیآمینها بهوسیله آنزیمهای آمیناکسیداز شامل آمینواکسیدازهای حاوی مس (CuPAO) و پلیآمین اکسیدازهای (PAO) وابسته به FAD بهصورت اکسیداتیو دآمینه میشوند. شواهد زیادی مبنی بر نقش ضروری پلیآمیناکسیدازها در رشد و نمو گیاهان مانند اندامزایی و پیری و نیز پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی وجود دارد. در دسترس قرار گرفتن توالی ژنوم ذرت فرصت بسیار مناسبی برای مستندسازی، گروهبندی و نیز مطالعات ژنومیکس مقایسهای مهیا ساخته است. در این مطالعه از طریق آنالیزهای بیوانفورماتیک، ZmPAO1تاZmPAO9 در ژنوم ذرت شناسایی شد. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که ژنهای ZmPAO همانند اورتولوگ آنها در آرابیدوپسیس و برنج به سه گروه اصلی تقسیم میشوند. ضمن اینکه ژنهای PAO ذرت ارتباط تکاملی نزدیکتری با ژنهای برنج در مقایسه با آرابیدوپسیس دارند. مطالعه ساختار ژنی نشان داد که تعداد اینترونهای ZmPAO از صفر تا نه متغیر است و روی چهار کروموزوم از ده کروموزوم ذرت قرارگرفتهاست. مضاعف شدگی تاندوم و سگمنتال موجب افزایش تعداد اعضای خانواده ژنی PAO در ذرت شدهاند. با استفاده از دادههای ریزآرایه در دسترس، پروفایل رونوشتبرداریژنهایZmPAO در فرآیندهای رشد و نمو ذرت ارزیابی و نتایج نشاندهنده نقش احتمالی آنها در تنظیم نمو بود. نتایج این مطالعه اطلاعات پایهای را ارایه کرد که برای مطالعات عملکردی آینده در مورد فعالیت ژنهای ZmPAO در بافتها، نقش آنها در نمو و نیز در پاسخ به تنشها مفید و موثر است.