بررسی تنوع ژنتیکی نمونه ای از ژرم پلاسم جو وحشی (Hordeum spontaneum) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

نویسندگان

1 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

2 استادیار، گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

3 استادیار، گروه کشاورزی دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

4 استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

5 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

6 دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

doi
چکیده

تعیین سطح تنوع ژنتیکی و روابط بین ژنوتیپ­ها جهت شناسایی والدین مناسب برای اهداف اصلاحی مختلف ضروری است. در این تحقیق، روابط ژنتیکی 55 نمونه از ژرم­پلاسم جو وحشی اسپونتانئوم (Hordeum spontaneum) متعلق به مناطق مختلف جهان با استفاده از 14 جفت آغازگر ریزماهواره بررسی شد. در مجموع 53 آلل با میانگین 2/5 آلل به ازای هر جفت آغازگر تکثیر شد. میانگین فراوانی آلل رایج 51/0 بود. میزان اطلاعات چند شکلی در دامنه 37/0 تا 81/0 با میانگین 63/0و تنوع ژنی یا هتروزیگوسیتی مورد انتظار در محدوده 38/0 تا 82/0 با میانگین 64/0 بود. نتایج حاصل از ارزیابی شاخص­های تنوع نشان داد که نشانگرهای Bmag007، EBmac0701 و Bmac134 مناسب­ترین نشانگرها برای تفکیک ژنوتیپ­ها بودند. تجزیه خوشه­ای با روش UPGMA بر اساس داده­های مولکولی، ژنوتیپ­ها را به شش گروه تقسیم کرد. ژنوتیپ­های موجود در هر یک از گروه­ها، عموما از یک منطقه جغرافیایی خاص جمع­آوری شده بودند. در تعدادی از نمونه­ها نیز تطابق بین توزیع جغرافیایی با گروه­بندی ژنوتیپ­ها مشاهده نشد. بر اساس نتایج، بیشترین شباهت را ژنوتیپ­های سوریه و اردن و کمترین شباهت را نمونه­های قزاقستان با این دو کشور داشتند. نتایج این تحقیق وجود تنوع ژنتیکی قابل توجه در نمونه­های جو وحشی مورد مطالعه را نشان داد که با شناسایی ژن­های مفید، می­توان از آنها جهت اصلاح و بهبود ارقام زراعی استفاده کرد.