فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

هدف: به دلیل اهمیت اقتصادی پشم گوسفند، تاکنون تحقیقات گسترده ای در زمینه ساختار و اساس ژنتیکی آن صورت گرفته است. شناسایی ژن‌ های مؤثر بر صفات اقتصادی از اهداف مهم اصلاح نژادی در پرورش گوسفند است. از پتانسیل ژنتیکی و عملکردی ژن ها می توان در جهت دستیابی به محصولات تولیدی با بهترین کیفیت و کمیت استفاده نمود. برای تجزیه و تحلیل داده‌های حجیم، روشهای تعیین توالی مقرون به صرفه‌ای وجود دارد که به درک مکانیسم‌ها و زمینه ژنتیکی صفات مختلف کمک کرده است. شناسایی ویژگی‌های متفاوت ژن‌های کاندید و انواع ژنوتیپ‌های مرتبط با صفات مهم فنوتیپی، در اصلاح نژاد حیوانات ضروری است. لذا، هدف از مطالعه حاضر شناسایی ژن های موثر بر تولید الیاف پشم در گوسفند بر پایه آنالیزهای عملکردی آن ژنها می باشد.مواد و روش‌ها: ابتدا داده‌های مورد استفاده برای این تحقیق از پایگاه داده‌ای GEO با شماره دسترسی GSE85844 دانلود شدند. در پژوهش حاضر معیار انتخاب ژن‌ها تفاوت بیان در دامنه (<-0.3 0.3< LogFC) و آماره P-value در سطح کمتر از 5 درصد بود. پس از شناسایی و مشخص شدن ژن‌ها با تفاوت معنی‌دار برای آنالیز هستی‌شناسی ژن‌ها از پایگاه داده DAVID استفاده شد. به منظور بررسی برهمکنش و ارتباط بین ژن‌های درگیر در تولید الیاف پشم از پایگاه اطلاعاتی STRING استفاده و آنالیز شبکه توسط بسته نرم افزاری Cytoscape انجام شد. نتایج: تعداد 1008 ژن با بیان متفاوت و معنی‌دار شناسایی شد (p<0.05). ژن‌ها با Log FC <- 0.3 بیان پایینی دارند و تعداد آن‌ها 431 عدد بود و ژن‌های با Log FC> 0.3 بیان بالایی دارند و تعداد آن‌ها 577 عدد است. نتایج هستی‌شناسی برای ژن ‌های CHRD و PLOD1 BMP4 و ITGA5 نشان داد که این ژن‌ها در مسیرهای مرتبط با مورفوژنز و ساخت تارهای مو، بازسازی فولیکول‌های مو و توسعه و تراکم پوست مؤثر هستند.نتیجه گیری: انتخاب برای بهبود کیفی در پشم تولیدی در گوسفندان با استفاده از این یافته‌ ها، سبب تسریع پیشرفت ژنتیکی برنامه های اصلاح نژادی مرتبط خواهد گردید.