تنوع ژنتیکی و بیماریزایی جدایههای Xanthomonas translucens عامل لکه نواری باکتریایی گندم در استانهای خراسان
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
2 دانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
3 استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
doi
10.22103/jab.2023.20497.1441چکیده
هدف: لکه نواری باکتریایی گندم یکی از مهمترین بیماریهای باکتریایی گندم در سراسر جهان است. گونه Xanthomonas translucens سبب بروز این بیماری میشود. بررسی بیماریزایی جدایههای به دست آمده از لکه نواری باکتریایی بر روی بوتههای گندم، بررسی مقاومت ارقام مختلف گندم در برابر جدایه با بالاترین قدرت بیماریزایی، شناسایی مولکولی جدایهها و بررسی تنوع ژنتیکی جدایهها از اهداف این تحقیق به شمار میرود. مواد و روشها: نمونهبرداری از مزارع گندم آلوده به این بیماری در سه استان خراسان رضوی، خراسان شمالی و لرستان انجام شد. قسمتهای دارای علائم پس از ضد عفونی سطحی و ایجاد سوسپانسیون در آب مقطر استریل، روی محیط آگار غذایی حاوی سوکروز کشت شدند. آزمون بیماریزایی تمام جدایهها روی بوتههای گندم رقم فلات بررسی شد. مقاومت ارقام مختلف گندم در برابر جدایه نماینده مورد بررسی قرار گرفت. آزمون rep-PCR با استفاده از آغازگرهای ERIC و BOX برای ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایهها استفاده شد. برای شناسایی جدایههای نماینده، بخشی از ژنهای gyrB و dnaK جدایهها تکثیر و توالییابی شدند. نتایج: کلونیهای باکتریایی با مشخصات زرد روشن، گرد و صاف جداسازی و خالص گردید. آزمون بیماریزایی تمام جدایهها روی بوتههای گندم اثبات گردید. جدایهها در میزان بیماریزایی روی گندم متفاوت بودند. جدایه با بالاترین میزان بیماریزایی، به ارقام مختلف گندم تلقیح شد. پاسخ ارقام مختلف گندم به جدایه منتخب متفاوت بود اما در نهایت همگی به این جدایه حساس بودند. آنالیز خوشهای الگوی باندی به دست آمده با آغازگرهای ERIC و BOX با استفاده از برنامه NTSYS انجام گردید. نتایج بررسیهای مولکولی با تکنیک انگشت نگاری DNA نشان داد که تنوع ژنتیکی بین جدایههای لکه نواری باکتریایی به دست آمده از مناطق مختلف کشت گندم مورد مطالعه وجود دارد. در دندروگرام ترکیبی رسم شده حاصل از دو نشانگر، جدایهها در سطح تشابه 33% به پنج گروه تقسیم شدند. مقایسه توالی نوکلئوتیدی جدایههای نماینده با توالیهای مشابه در ژن بانک، نشان دهنده تشابه بالای توالیهای مورد بررسی با توالیهای Xanthomonas translucens pv. undulosa موجود در ژن بانک NCBI بود. نتیجهگیری: استفاده از آزمون rep-PCR برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای به دست آمده مناسب میباشند. در این مطالعه موقیعت جغرافیایی اثری بر روی گروهبندی جدایهها نداشت. بیماری نواری باکتریایی تقریبا در تمام مناطق کشت گندم یافت میشود و درک بهتر برهمکنش گیاه- بیمارگر در Xanthomonas translucens-گندم برای یافتن و توسعه ارقام مقاوم به این بیماری ضروری به نظر میرسد.