روابط ژنتیکی بین گونهها و ارقام جنس پسته (Pistacia L.) بهوسیله نشانگر SCoT
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری گروه مهندسی تولید و ژنتیک بهنژادی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
2 گروه مهندسی تولید و ژنتیک به نژادی ، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، اردبیل، ایران
3 استاد، گروه ژنتیک و تولید گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولیعصر (عج) رفسنجان، رفسنجان- ایران
4 استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ولیعصر (عج) رفسنجان، رفسنجان- ایران
5 استادیار پژوهشی، پژوهشکده پسته، مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رفسنجان، ایران
doi
10.22103/jab.2022.18817.1374چکیده
هدف: پسته یکی از مهمترین محصولات کشاورزی میباشد و کشور ایران دارای غنیترین ژرمپلاسم پسته دنیاست. وجود این ذخایر ژنتیکی فرصتی مناسب جهت استفاده برای اهداف اصلاحی خواهد بود. آگاهی از روابط ژنتیکی بین ژنوتیپهای پسته نقش مهمی در برنامههای اصلاحی آن دارد. نشانگرهای مولکولی یکی از ابزارهای قدرتمند جهت بررسی روابط فیلوژنتیک گیاهان میباشند. تکنیک SCoT یکی از سیستمهای مولکولی است که جهت بررسی ارتباط ژنتیکی گونهها و ارقام مختلف گیاهی کاربرد دارد. این مطالعه به منظور ارزیابی روابط ژنتیکی تعدادی از گونهها و ارقام جنس پسته با استفاده از نشانگر مولکولی SCoT و بررسی سودمندی این نشانگر در تمایز ژنوتیپهای این جنس انجام شد.مواد و روشها: مواد گیاهی این مطالعه شامل 29 ژنوتیپ از گونههای اهلی و وحشی جنس پسته است. 25 آغازگر از نشانگر SCoT جهت ارزیابی روابط ژنتیکی مورد استفاده قرار گرفت. DNA ژنومی از نمونههای برگی با استفاده از روش CTAB با اندکی تغییر استخراج گردید. کمیت و کیفیت DNA استخراجشده به وسیله اسپکتروفتومتر و الکتروفورز ژل آگاروز تعیین گردید. تجزیه خوشهای بر اساس ماتریس تشابه ژاکارد و الگوریتم اتصال کامل و تجزیه به مؤلفههای هماهنگ اصلی، با استفاده از نرمافزار 2.02e NTSYSpc انجام شدند.نتایج: در مجموع 449 قطعه DNA توسط آغازگرها تکثیر گردید که 433 باند (43/96 درصد) چندشکل بودند. متوسط تعداد قطعات تکثیری برای هر آغازگر 96/17 باند با میانگین 32/17 باند چندشکل در هر آغازگر بود. تعدادی نشانگر اختصاصی گونه نیز در بعضی ژنوتیپها آشکار گردید. مقادیر میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی از 18/0 تا 38/0 متغیر بود. همچنین مقادیر شاخص نشانگری در محدوده 56/0 تا 36/4 قرار داشت. دامنه ضرایب تشابه ژنو تیپها بین 25 تا 68 درصد متغیر بود. تجزیه خوشهای، ژنوتیپهای پسته را به دو شاخه اصلی شامل گونه ورا (اهلی) و گونههای وحشی تقسیم نمود. تجزیه به مؤلفههای هماهنگ اصلی، گونه ورا را از گونههای وحشی تفکیک و نتایج تجزیه خوشهای را تأیید نمود.نتیجهگیری: نتایج این مطالعه نشان داد که نشانگر مولکولی SCoT چندشکلی بالایی را در بین گونهها و ارقام پسته آشکار و ژنوتیپهای موردمطالعه را از یکدیگر متمایز ساخت. بنابراین، نشانگر SCoT ابزاری سودمند جهت مطالعه روابط فیلوژنتیک در جنس پسته است.