ارزیابی روابط ژنتیکی گونههای آژیلوپس با استفاده نشانگرهای چندشکلی نواحی هدفمند (TRAP)
نویسندگان
1 قزوین دانشگاه بین المللی امام خمینی (ره)
2 گروه اصلاح و بیوتکنولوژی دانشگاه ایلام
3 دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و بهنژادی گیاهی، دانشگاه بینالمللی امام خمینی (ره)، قزوین، ایران.
doi
10.22103/jab.2022.17493.1314چکیده
هدف: هدف این تحقیق تعیین روابط و سطح تنوع ژنتیکی بین و درون گونههای وحشی آژیلوپس با استفاده از نشانگرهای ملکولی TRAP که مبتنی بر نواحی EST هستند، میباشد.مواد و روشها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی و روابط بین گونههای وحشی آژیلوپس جمعآوری شده از 14 استان ایران متشکل از هشت گونه Aegilops با استفاده از 24 ترکیب آغازگرهای TRAP مورد ارزیابی قرار گرفتند.نتایج: میانگین PIC آغازگرهای مورد مطالعه برابر 95/0 و کمترین و بیشرین میزان این شاخص بهترتیب مربوط به آغازگرهای (92/0) TRAP20 و (97/0) TRAP10 بود. همچنین میانگین شاخص نشانگری (MI) برابر 77/10 و کمترین و بیشرین میزان این شاخص بهترتیب مربوط به آغازگرهای (95/6) TRAP3 و (34/17) TRAP17 بود. نتایج تجزیه واریانس ملکولی، واریانس بین گونهها را 60 و واریانس درون گونهها را 40 درصد نشان داد. پارامترهای ژنتیکی برآورد شده نشان داد که بیشترین میزان Na (07/1)، Ne (26/1)، I (23/0) و uHe (16/0) مربوط به گونه Ae. truncialis و حداکثر شاخص تنوع ژنی نی (14/0) مربوط به گونههای Ae. truncialis، Ae. umbelulata و Ae. neglecta بود. حداقل مقدار شاخصهای تنوع ژنی نی (09/0)، شاخص شانون (14/0)، تعداد آلل موثر (16/1) و تعداد آلل مشاهده شده (79/0) برای گونه Ae. crassa مشاهده شد. کمترین تشابه ژنتیکی بین Ae. crassa با گونههای Ae. cylandrica و Ae. umbelulata و بیشترین تشابه بین Ae. triuncialis و Ae. umbelulata مشاهده شد. قرار گرفتن Ae. umbelulata و Ae. truncialis در یک گروه در تجزیه خوشهای و تجزیه به مختصات اصلی و با فاصله زیاد از سایر گونهها شباهت ژنتیکی بالای این دو گونه را تائید کرد.نتیجهگیری: نتایج تحقیق تنوع ژنتیکی بالایی را در بین و درون گونهها نشان داد. تجزیه واریانس ملکولی تنوع ژنتیکی بالاتر در بین گونهها را مشخص کرد که این نتیجه نمایانگر جریان ژنی و شاخص تثبیت (Fst) پایین در بین گونهها و نیز تایید کننده تمایز ژنتیکی بالا در بین گونهها بود.