مطالعه تغییرات بیان Pdu-miR319a، Pdu-miR398a و ژنهای هدف آنها در اندامهای زایشی بادام تحت تنش سرما
نویسندگان
1 شهرکرد- دانشگاه شهرکرد-دانشکده کشاورزی -گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی
2 استادیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد
3 گروه زیست شناسی، دانشکد ه علوم، دانشگاه رازی کرمانشاه
4 شهرکرد-دانشگاه شهرکرد- دانشکده کشاورزی- گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی
doi
10.22103/jab.2021.15888.1236چکیده
درخت بادام به دلیل نیاز سرمایی کم، به سرمای دیررس بهاره حساس بوده و همه ساله متحمل خسارات جبرانناپذیری توسط این تنش میشود. لازمه توسعه ارقام متحمل با استفاده از روشهای مهندسی ژنتیک، شناخت مکانیسمهای مولکولی دخیل در پاسخگیاه به تنش سرما میباشد. در مطالعات اخیر نقش مهم RNAهای کوچک به ویژه میکروRNAها در پاسخ و سازگاری گیاهان به تنشهای زیستی و غیرزیستی اثبات شده است. از اینرو بر اساس نتایج توالییابی sRNAهای بادام از میان میکروRNAهای پاسخ دهنده به تنش سرما، در این مطالعه Pdu-miR319a و Pdu-miR398a-3p انتخاب و الگوی بیان آنها به همراه ژن هدفشان در بین دو ژنوتیپ متحمل و حساس به سرمای بادام تحت تنش سرما مورد مقایسه قرار گرفتند. مواد و روشها: در این آزمایش بافتهای زایشی بساک و تخمدان ژنوتیپ متحمل H و رقم حساس به سرمای Sh12 تحت تیمارهای صفر و 2- درجه سانتیگراد قرار گرفتند. پس از استخراج RNA و سنتز cDNA، واکنش Real time PCR انجام و تجزیه و تحلیل دادههای بیان نیز با استفاده از روش ΔΔct 2- صورت گرفت. نتایج: ژن miR319a با اثر تنظیمی مثبت در پاسخ به هر دو سطح تنش سرما در هر دو ژنوتیپ شناسایی گردید. کاهش بیان GAMYB-like در هر دو بافت زایشی ژنوتیپ H در پاسخ به تنش صفر درجه سانتیگراد و نیز در بافت تخمدان Sh12 در پاسخ به هر دو سطح تنش مشاهده شد. ژن TCP4 در ژنوتیپ H در پاسخ به هر دو سطح تنش افزایش معنیداری را نشان داد. MiR398a-3p با اثر تنظیمی منفی در ژنوتیپ H شناسایی شد. اما افزایش بیان ژن CTR6 در هر دو بافت در پاسخ به تنش 2- درجه سانتیگراد مشاهده گردید. در رقم Sh12 افزایش بیان miR398a-3p و کاهش بیانCTR6 در بافت تخمدان Sh12 در پاسخ به تنش 2- درجه سانتیگراد مشاهده شد. نتیجهگیری: با توجه به مشاهده افتراق بیان ژنهای مورد مطالعه در بین دو ژنوتیپ متحمل و حساس، به منظور تکمیل اطلاعات مولکولی در رابطه با عملکرد آنها، توصیه میشود بیان آنها در سایر ارقام متحمل و حساس و تحت تیمارهای مختلف تنش سرمایی نیز سنجیده شود و به دنبال آن عملکرد آنها با استفاده از روشهایی نظیر بیش بیان کردن ژنها، تکنولوژی amiRNA و روش target mimicry بررسی گردد.