بررسی چندشکلی ژن Hsp70 در مرغهای بومی استان خوزستان
نویسندگان
1 نویسنده مسئول، استادیار گروه علوم دامی –دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی -دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان-ملاثانی-ایران
2 استادیار سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی شعبه اهواز، گروه جانوران سمی و تولید پادزهر، اهواز، ایران
3 دانشجوی دکتری علوم دامی –دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی -دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان-ملاثانی-ایران.
doi
10.22103/jab.2020.12806.1081چکیده
چکیده هدف: پروتئینهای شوک حرارتی 70 (Hsp70) خانوادهای از چاپرونهای مولکولی هستند که برای تاخوردگی صحیح پروتئینها و بسیاری از فعالیت های سلولی مورد نیاز هستند. هدف از این تحقیق تعیین چندشکلی ژن شوک حرارتی ۷۰ مرغ بومی استان خوزستان با استفاده از تکنیک SSCP بود. مواد و روشها: بدین منظور از ۱۳۰ مرغ بومی شهرستانهای اندیمشک، شوش، رامهرمز و ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی جهاد (شهرستان باوی) خونگیری بهعمل آمد. پس از استخراج DNA، ناحیه موردنظر (359 جفت بازی ابتدای ژن) توسط آغازگرهای اختصاصی به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز تکثیر و توالییابی شد. نتایج: نتایج نشاندهنده وجود چندشکلی در قسمت ابتدایی ژن شوک حرارتی ۷۰ بود که توسط توالییابی محصولات PCR تایید گردید و دو جایگاه چندشکل در این منطقه شناسایی شد: یک جهش از نوع انتقال در موقعیت ۲۵۹+(A259G) سبب جایگزینی گوانین با آدنین و یک جهش از نوع جابجایی در موقعیت ۲۷۷+ (C277G) سبب جایگزینی گوانین با سیتوزین. آزمون مربع کای نشان داد که جایگاههای مورد بررسی در حالت تعادل هاردی-وینبرگ نیستند. بهعلاوه، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و تعداد آلل موثر نشان داد که میزان تنوع این جایگاهها در جمعیت بالاست. بعلاوه، هاپلوتیپ H3 بیشترین فراوانی را در جمعیت داشت. در این هاپلوتیپ جهش از نوع A259G رخ داده است. نتیجه گیری: باید در حفظ این جمعیت کوشید تا در آینده بتوان از این مخازن با ارزش در صورت نیاز اسفاده نمود. انتخاب در مرکز اصلاح نژاد دام جاهد سبب افزایش همخونی و در نتیجه فراوانی هاپلوتیپ H3 در جمعیت شده است.