آنالیز فیلوژنتیکی ناحیه سیتوکرومB ژنوم میتوکندری چند نژاد بز بومی ایران
نویسندگان
1 فارغ التحصیل کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
2 استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
3 استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور،
4 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران.
5 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران
doi
10.22103/jab.2020.2521چکیده
هدف: شناسایی تنوع ژنتیکی نژادهای بز بومی ایران، میتواند در حفاظت و نگهداری از این نژادها در برنامههای مدیریتی نقش بسیار مهمی ایفا کند. لذا این پژوهش با هدف بررسی فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم b ژنوم میتوکندری چهار نژاد لری، پاکستانی، زابلی و عدنی انجام شد. مواد و روشها: نمونه خون 16 رأس بز، از هر نژاد 4 رأس، جمعآوری گردید. پس از استخراج DNA، تکثیر قطعه 684 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری با آغازگرهای اختصاصی انجام شد و قطعات تکثیر شده پس از خالصسازی به صورت رفت و برگشت توالییابی شدند. با نرمافزار DNASpشش هاپلوتیپ و 9 جایگاه چندشکل در توالیها تعیین گردید. نتایج: بیشترین تنوع نوکلئوتیدی مربوط به نژاد پاکستانی 35461/0 و کمترین تنوع نوکلئوتیدی مربوط به نژاد زابلی 11199/0 به دست آمد. مقدار dn/ds نمونههای تاجیمای مورد بررسی 06945/1 برآورد شد که موید روند انتخاب طبیعی این ژن در طول دوره تکامل بود. همچنین نتایج حاصل از آنالیز واریانس مولکولی نشان داد 80 درصد تنوع ژنتیکی داخل جمعیتی و 20 درصد بین جمعیتی بود که نشان دهنده جریان ژنی بالا، مهاجرت در بین جمعیتهای مورد مطالعه و یا تعداد محدود نمونههای مورد پژوهش میباشد. نتیجهگیری: نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد بزهای نژاد لری و عدنی به همراه Capra hircus در یک گروه و بزهای نژاد پاکستانی و زابلی نیز به صورت مجزا گروه تشکیل دادند که این امر نشان دهنده منشا مشترک این نژادها با توجه به منطقه جغرافیایی محل زندگی آنها است.