فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

هدف: کاهو یکی از قدیمی‌ترین سبزی‌های دنیاست که منشأ آن در هندوستان و آسیای مرکزی است. در این تحقیق تنوع ژنتیکی 15 ژنوتیپ کاهو با استفاده از توالی ژن rbcl مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش­ها: توالی 15 ژنوتیپ کاهو ابتدا با روش PCR جداسازی و سپس توالی یابی شد. کیفیت توالی‌ها با استفاده از نرم‌افزار Chromas 2.1.1 بررسی و سپس با روش ClustalW توسط نرم‌افزار MegAlign 5 هم‌ردیف سازی شده و دندروگرام روابط تبار­زایی و ماتریس تفاوت و تشابه توالی‌ها ترسیم گردیدند. همچنین برای مدل‌سازی و اعتبار سنجی پروتئین rbcl از SWISS-MODEL و QMEAN و ارزیابی ساختار و کیفیت شیمیایی پروتئین از نقشه­های راماچاندران و سرور Pro-SA استفاده شد. نتایج: بررسی شبکه­های متقابل پروتئین- پروتئین با استفاده از نرم‌افزار STRING نشان داد اکثر پروتئین­های کد شده با ژن­های matK، psb-tranH با پروتئین rbcl اثر متقابل دارند. نتایج حاصل از تجزیه خوشه­ای، ماتریس تشابه و واریانس مولکولی و همچنین 1< dN/dS، همگی حاکی از وجود شباهت و حفاظت‌شدگی بالای توالی­ rbcl بین ژنوتیپ­های مورد مطالعه بود. نتیجه‌گیری کلی: نتایج نشان داد که برای بررسی روابط فیلوژنتیکی در سطح گونه توالی rbcl چندان مفید نیست لذا می­توان گفت که یکی از علل عدم موفقیت این ناحیه در تفکیک گونه­ها، تغییرپذیری کم آن در بین گونه­ها است.