امکان‌سنجی تئوری استفاده از نانوحلقۀ کربنی آرمچیر و زیگزاگ برای توالی‌یابی مولکول زیستی دی‌ان‌ای به روش نظریة تابعی چگالی

نویسندگان

1 گروه فیزیک، دانشکدة مهندسی انرژی و فیزیک، دانشگاه صنعتی امیرکبیر، تهران

2 گروه فیزیک، دانشکدة مهندسی انرژی و فیزیک، دانشگاه صنعتی امیرکبیر، تهران

3 گروه فیزیک، دانشکدة مهندسی انرژی و فیزیک، دانشگاه صنعتی امیرکبیر، تهران

doi
10.47176/ijpr.22.4.51450
چکیده

در این پژوهش برهمکنش بازهای دی‌ان‌ای با نانوحلقه­های آرمچیر (Armchair) و زیگزاگ (Zigzag) بررسی شدند. مطالعات بر پایة نظریة تابعی چگالی براساس تابعی هیبریدی B3LYP است. برای بالا بردن دقت مطالعه از تصحیح انرژی واندروالسی ناشی از برهمکنش دوقطبی استفاده شده است. انتقال بار الکتریکی خالص بین پایه های دی‌ان‌ای با نانوحلقه مشاهده نشد. این موضوع نشان از جذب فیزیکی بین نانوحلقه و پایه‌های دی‌ان‌ای است. مقدار برهمکنش بین نانوحلقۀ کربنی آرمچیر(9/9) و نانوحلقۀ زیگزاگ (15/0) به ترتیب به صورت گوانین > آدنین > سیتوزین > تیمین و آدنین ≈ گوانین > سیتوزین > تیمین است. بنابراین احتمالاً نانوحلقۀ آرمچیر(9/9) توانایی توالی‌یابی مولکول دی‌ان‌ای را دارد.