بررسی فیلوژنتیکی جدایههای جدید ایرانی ویروس بادنای یک انجیر بر اساس ترادف ژن پروتئین حرکتی
نویسندگان
1 استاد بخش تحقیقات بیوتکنولوژی میکروبی، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران (ABRII)، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی (AREEO)، کرج.
2 ﺩﺍﻧﺸﻴﺎﺭ ﮔﺮﻭﻩ ﺑﻴﻤﺎﺭﻱ ﺷﻨﺎﺳﻲ ﮔﻴﺎﻫﻲ، ﺩﺍﻧﺸﻜﺪﻩ ﻛﺸﺎﻭﺭﺯﻱ، ﺩﺍﻧﺸﮕﺎﻩ ﺗﺮﺑﻴﺖ ﻣﺪﺭﺱ
3 دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، داﻧﺸﮕﺎه آزاد اﺳﻼﻣﻲ واﺣﺪ ﻋﻠﻮم و ﺗﺤﻘﻴﻘﺎت ﺗﻬﺮان.
4 اﺳﺘﺎدﻳﺎر ﮔﺮوه ﺑﻴﻤﺎری ﺷﻨﺎﺳﻲ ﮔﻴﺎﻫﻲ، داﻧﺸﻜﺪه ﻛﺸﺎورزی و ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻃﺒﻴﻌﻲ، داﻧﺸﮕﺎه آزاد اﺳﻼﻣﻲ واﺣﺪ ﻋﻠﻮم و ﺗﺤﻘﻴﻘﺎت ﺗﻬﺮان.
doi
10.22103/jab.2017.1755چکیده
بیماری موزائیک انجیر گسترش جهانی دارد و به عنوان شایعترین بیماری ویروسی در انجیر شناخته میشود. یکی از مهمترین ویروسهایی که در این بیماری نقش دارد، ویروس بادنای یک انجیر (FBV-1) میباشد. در تحقیق حاضر، روابط فیلوژنتیکی بین جدایههای ایرانی و سایر جدایههای گزارش شده از این ویروس مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن رمز کننده پروتئین حرکتی ویروس، قطعهی مورد انتظار به اندازه تقریبی 1090 جفت باز از ژنوم ویروس تکثیر شد. قطعه ژنی 12 جدایه در پلاسمید pTZ57R/T همسانه و تعیین توالی شد. ترادفهای به دست آمده با ترادفهای موجود در بانک ژن مقایسه و پس از همردیفسازی چندگانه، درخت فیلوژنتیکی بر اساس ژن پروتئین حرکتی FBV-1 ترسیم شد. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایههای FBV-1 در دو گروه متمایز دستهبندی شدند و جدایههای ایرانی در دو زیرگروه با 99% مشابهت نوکلئوتیدی در گروه اول قرار گرفتند. در بررسی تبارزایی بر مبنای توالی اسیدآمینهای، جدایه های مورد بررسی در سه گروه با 99-98 % مشابهت قرار گرفتند. جدایههای ایرانی از تنوع ژنتیکی پایینتری در مقایسه با جدایههای آمریکایی برخوردار بودند و شرایط جغرافیایی در تنوع ژنتیکی جدایههای موجود تاثیر داشت.