شناسایی ژنتیکی و طبقه بندی آرتمیای ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
نویسندگان
1
2
3
4
doi
10.22103/jab.2015.1138چکیده
در این پژوهش، تنوع ژنتیکی جمعیت آرتمیا اورمیانا و آرتمیا فرانسیسکانای موجود در ایران با استفاده از 5 جفت آغازگر ریزماهوارهای (Af-B105TAIL، Af-A136، Apdq03TAIL، Apdq04TAIL و Apdq05TAIL) ویژهی آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا پارتنوژنتیکا بررسی شد. DNA ژنومی 50 سیست آرتیمیا از هر جمعیت به صورت انفرادی و با روش گلولهی داغ استخراج شد. محصولات PCR با استفاده از 5 جفت آغازگر با موفقیت تکثیر و فرآوردههای حاصل بر روی ژل پلی اکریل آمید واسرشتهساز 6% الکتروفورز شده و با روش نیترات نقره رنگ آمیزی گردیدند. تمامی جایگاهها چندشکل بودند. میانگین تعداد آللها و محتوای اطلاعات چند شکلی (PIC) برای جمعیت آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا بهترتیب برابر با 3، 5428/0 و 5/2، 3833/0 بود. در آرتمیا اورمیانا تمامی جایگاهها در تعادل هاردی-وینبرگ قرار داشتند، در حالی که در آرتمیا فرانسیسکانا تنها جایگاه Af-A136 در تعادل هاردی-وینبرگ قرار داشت. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار برای آرتمیا فرانسیسکانا و آرتمیا اورمیانا بهترتیب 6209/0 و 4531/0 محاسبه شد. دندروگرام فیلوژنتیکی در داخل جمعیتها براساس فاصلهی ژنتیکی و با استفاده از روش UPGMA ترسیم گردید. براساس تعداد آللها و فراوانی آنها در جمعیت آرتمیاهای مورد بررسی میتوان دریافت که این جمعیتها از ترکیب ژنتیکی مناسبی برخوردار هستند.