بررسی تنوع ژنتیکی و تجزیه ساختار جمعیت ژرمپلاسم انار شیرین ایران با استفاده از نشانگرهای SSR
نویسندگان
1
2
3
4
doi
10.22103/jab.2014.1227چکیده
ایران یکی از بزرگترین تولیدکنندگان و صادرکنندگان انار در دنیاست. هرچند تعداد گونههای جنس Punica بسیار کم است، تنوع مورفولوژیک بسیار بالایی در داخل ارقام و ژنوتیپهای موجود در کشور مشاهده میشود. لذا بمنظور تفکیک ژرمپلاسم غنی انار موجود در کشور، استفاده از نشانگرهای مناسب ضروری است. بهمین منظور در این مطالعه، 6 نشانگر چند شکل از میان 50 آغازگر ریزماهواره مورد بررسی، بر روی 194 نمونه موجود در ژرمپلاسم انار شیرین مورد آزمایش قرار گرفتند. در مجموع تعداد 24 آلل مشاهده گردید که تعداد آن در هر مکان ژنی در دامنهای بین 2 تا 8 آلل قرار داشت. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی این آغازگرها 746/0 و میانگین ناخالصی 778/0 بدست آمد که ماهیت قوی نشانگرهای ریزماهواره را در بررسی روابط و تنوع ژنتیکی اثبات میکند. تجزیه خوشهبندیبا روشهای UPGMA و NJ٬ نرم افزار MEGA4 و تجزیه ساختار با روش Bayesian نرم افزار STRUCTURE2.3 و تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) با نرم افزار NTSYS، بمنظور بررسی روابط ژنتیکی و ساختار جمعیت نمونهها انجام شد. بررسی نتایج تمامی روشهای ذکر شده نشان داد که طبقهبندی ارقام و ژنوتیپهای مورد مطالعه مستقل از منشا جغرافیایی و نام گذاری پیشنهادیشان میباشد که این امر اختلاط شدید در ژرمپلاسم انار شیرین موجود را اثبات مینماید. بررسی مطالعه انجام شده وجود تنوع ژنتیکی بالایی را در ژرمپلاسم انار شیرین ایران اثبات میکند که میتواند برای اهداف اصلاحی مورد توجه قرار گیرد.