فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

تحلیل توالی‌های ژنی نقطه شروع درک عملکرد ارگانیسم‌های بیولوژیکی است. در سال‌های اخیر، هزینه‌های توالی‌برداری ژن به‌شدت کاهش یافته است و مقدار زیادی از داده‌های ژنومی درحال تولید هستند. ازطرفی، هزینه حافظه ذخیره‌سازی، پردازش و انتقال این داده‌ها درحال افزایش است. پردازش این حجم عظیم اطلاعات بیشتر توسط روش‌های کاراکتر مبنا صورت می‌گیرد که زمان‌بر است. ظرفیت‌های بالقوّه فراوانی برای مقابله با این چالش‌ها در حوزه پردازش سیگنال وجود دارد. بنابراین، نگاه سیگنالی به دنباله‌های ژنی، پردازش سیگنال ژنوم و فشرده‌سازی آن می‌تواند مفید واقع شود. فشرده‌سازی سیگنال‌ها هزینه برای آنالیز، فضای حافظه برای ذخیره‌سازی، پهنای باند برای مبادله و زمان مورد نیاز برای تحلیل را کاهش می‌دهد. در این مقاله ابتدا دنباله‌های ژنی کاراکتری به‌صورت سیگنالی بیان شدند. سپس، سیگنال‌های ژنومی حاصل توسط روش حسگری فشرده مبتنی‌بر یادگیری بیزین فشرده‌سازی شدند. توانایی روش در بازسازی سیگنال‌های فشرده شده با استفاده از معیارهای PRD و NMSE مورد بررسی قرار گرفت. سپس به‌منظور مقایسه و بررسی مشابهت دنباله‌ها، درختچه فیلوژنتیک از روی سیگنال‌های فشرده شده با نرخ 75% رسم شد. نتایج نشان دادندکه مقایسه دنباله‌ها با روش سیگنال مبنا با صرف زمان بسیار کمتر 1.2853 ثانیه در مقایسه با روش کاراکتر مبنا با زمان 126 ثانیه صورت می‌گیرد.