کاوش ژنومیک تمایز جمعیتی در نژادهای زل و لری¬بختیاری
نویسندگان
1 دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
2 محقق ارشدبخش ژنومیکس و تولید مثل مرکزAgResearch نیوزیلند
3 محقق ارشدبخش ژنومیکس و تولید مثل مرکزAgResearch نیوزیلند
4 دانشجوی دکتری پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران کرج
5 هیئت علمی گروه اصلاح دام دانشگاه تهران
doi
10.22103/jab.2012.369چکیده
انتخاب برای افزایش فراوانی موتاسیونهای جدیدی که فقط در برخی از زیرجمعیتها سودمند هستند باعث باقی گذاشتن نشانههایی در سطح ژنوم میشود. شناسایی این مناطق ژنومی یکی از مهمترین حوزههای تحقیقاتی در ژنتیک حیوانی است، زیرا این مناطق اغلب با QTLهای مرتبط با صفات مهم اقتصادی در ارتباط هستند. در این تحقیق با هدف شناسایی مناطق ژنومی که در دو نژاد گوسفند ایرانی زل و لری-بختیاری هدف انتخابهای مختلف قرار گرفتهاند، یک کاوش ژنومیک با حدود 000,54 مارکر SNP انجام شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش FST ویر و کوکهام نشان داد که چندین منطقه ژنومی دارای شواهدی از انتخاب در این دو نژاد هستند. در این مقاله 5 ناحیه ژنومی که در صدک 99/99 کل ارزشهای FST قرار گرفته بودند برای بررسیهای بیشتر انتخاب شدند. این مناطق بر روی کروموزومهای 2، 5، 7 (دو ناحیه) و X واقع شدهاند. برای ارزیابی نشانههای انتخاب بر پایه روشهای عدم تعادل لینکاژی از آزمون هموزیگوسیتی هاپلوئیدی بسطداده شده استفاده شد. نتایج این آزمون به همراه بررسی دیاگرامهای شاخهبندی هاپلوتیپی در این دو نژاد وجود تفرق جمعیتی شدید در این مناطق ژنومی را تأیید کرد. در نهایت بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق اورتولوگوس گاوی نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با لاشه و تولید مثل همپوشانی دارند. این تحقیق که جزء اولین مراحل توسعه نقشه انتخاب در ژنوم گوسفند محسوب می شود میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در راستای شناسایی ژنهای متمایز کننده این دو نژاد فراهم آورد.