بررسی بیان ژن OsPP2C5، در شرایط تنشهای غیر زنده (شوری، خشکی و سرما) در برنج

doi
10.22103/jab.2010.1159
چکیده

پروتئین فسفاتاز‌های C2، گروهی از سرین/ترئونین فسفاتاز‌ها هستند که در ترارسانی پیام تنش نقش دارند. زیرخانواده‌ای از این پروتئین فسفاتاز‌ها در آرابیداپسیس، شامل ABI1 و ABI2، به عنوان جزئی از مسیر ترارسانی پیام اسید­آبسیزیک شناخته­شده‌اند. نه پروتئین در برنج شناسایی شده­اند، که دارای تمامی نواحی حفظ شده زیرخانواده مذکور هستند، تنها میزان بیان رونوشت‌های OsPP2C5 به شدت تحت تأثیر تنش خشکی و هورمون آبسیزیک­اسید افزایش و با آبیاری مجدد یا حذف اسید­آبسیزیک ‌کاهش می­یابد. در این پژوهش، الگوی بیان ژنOsPP2C5  تحت تنش­های شوری (١٠٠ میلی مولار نمک (NaCl))، خشکی (١٨۰ میلی­مولار مانیتول) و سرما (١٥ درجه سانتیگراد) در دانه رست­های دو روزه‌ لاین های IR29 وFL478  (به ترتیب مرجع حساسیت و تحمل به شوری) با استفاده از روش­های رونویسی معکوس- واکنش زنجیره­ای پلیمراز (RT-PCR) نیمه­کمی و واکنش زنجیره­ای پلیمراز در زمان واقعی (Real-time PCR) بررسی شد. میزان بیان ژن  OsPP2C5در دانه رست­های هر دو لاین­IR29  و FL478 در تنش­های خشکی و سرما نسبت به تیمارهای شوری و شاهد افزایش یافت. بر اساس نتایج به دست آمده از روش RT-PCR  نیمه­کمی و همردیفی توالی­های گزارش شده برای ژن مورد نظر در بانک ژن، سه رونوشت برای این ژن شناسایی شد. بیان دو رونوشت قابل تکثیر با آغازگرهای مورد استفاده در روشRT- PCR  نیمه­کمی در هر دو لاین­ مشاهده شد، اما میزان بیان رونوشت بزرگتر در لاین­ IR29 و میزان رونوشت کوچکتر (رونوشت اصلی) در لاین­ FL478 (در شرایط خشکی و سرما) بیشتر بود. به نظر می‌رسد نوع رونوشت و سطح بیان با میزان حساسیت لاین­ به تنش مورد بررسی، مرتبط است.