فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

زمینۀ مطالعه: کلستریدیوم پرفرنجنس باسیل گرم مثبت بی‌هوازی و دارای اسپور است که بیوتایپ A آن مسئول انواع بیماری‌ها از جمله التهاب روده، اسهال خونی و قانقاریای گازی و یکی از عوامل اصلی سندرم خونریزی دهنده روده گاوها می‌باشد. تنوع ژنتیکی می‌تواند بیشترین تنوع فنوتیپی، توزیع جغرافیایی، ویژگی میزبانی، بیماریزایی، مقاومت آنتی بیوتیکی و حدت را در باکتری‌ها توضیح دهد. روش مولکولی مبتنی بر الگوی باندهایDNA ، باکتری را بر اساس اندازه قطعات تولید شده توسط هضم آنزیمی ژنوم طبقه بندی می‌کند.هدف: استاندارد سازی و کاربرد تکنیک PCR-RFLP در شناسایی تنوع ژنتیکی جدایه‌های کلستریدیوم پرفرنجنس بیوتایپ A.روش‎کار: استخراج DNA ژنومی سویه‌ها و سنتز توالی کامل لوکوس ژنی توکسین آلفا با استفاده از پرایمرهای اختصاصی طراحی شده با تکنیک PCR انجام شد. برش آنزیمی آمپلیکون‌های سنتز شده با آنزیم محدودالاثر Mse1 انجام و قطعات حاصل با تکنیک الکتروفورز از یکدیگر تفکیک شدند و توسط نرم افزار‌های ImageJ وNTSYSPC  مورد بررسی قرار گرفتند.نتایج: یافته‌های به دست آمده نشان داد که توالی لوکوس ژنی توکسین آلفا ممکن است تغییرکند و حفاظت شده نباشد. در مطالعه حاضر چهار الگوی مختلف بر مبنای برش آنزیمی شناسایی شد. جهش در این لوکوس می‌تواند منجر به ایجاد تنوع در کلستریدیوم پرفرنجنس بیوتایپ A و ایجاد سویه‌های جدید شود.نتیجه­گیری نهایی: لوکوس ژنی توکسین آلفا می‌تواند یک نشانگر مولکولیDNA  در کلستریدیوم پرفرنجنس محسوب شود و تکنیک PCR-RFLP به عنوان ابزاری برای تایپینگ این باکتری و تخمین میزان روابط فیلوژنتیکی از طریق مطالعات مقایسه‌ای توالی‌های نوکلئوتیدی کاربرد داشته باشد.