ارزیابی تنوع ژنتیکی در جوجه‌گوشتی نژاد راس 308 با استفاده از نشانگر ریزماهواره LEI0258

نویسندگان

1 دانش آموخته دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

2 دانش آموخته دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

3 گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران

4 گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شیراز، شیراز، ایران

doi
10.22059/jvr.2022.326479.3173
چکیده

زمینۀ مطالعه: مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) مولکول‌های بسیار متغیری را کدگذاری می‌کند که بیشتر آن‌ها مسئول تشخیص پادگن و فعال شدن پاسخ‌های ایمنی در میزبان هستند. یک نشانگر ژنتیکی مناسب برای تعیین هاپلوتیپ‌های  MHCو تنوع ژنتیکی در طیور ریزماهواره LEI0258 است که در ناحیه MHC طیور قرار دارد.هدف: با توجه به این‌که تاکنون گزارشی مبنی بر فراوانی و انواع آلل­های MHC و تحلیل ژنتیک جمعیت در طیور راس 308 ایران در دست نیست، لذا هدف از  مطالعه حاضر بررسی تنوع هاپلوتیپ‌های MHC جوجه‌های گوشتی نژاد راس 308 توسط ریزماهواره LEI0258  است.روش‎کار: تعداد 216 نمونه خون از دو گله مولد جوجه گوشتی نژاد راس 308 تهیه شد. پس از استخراج DNA از نمونه‌های خون و افزوده‌سازی آلل‌های ریزماهواره LEI0258، ژنوتایپینگ هاپلوتیپ‌های MHC با استفاده از روش‌های آگارز ژل الکتروفورز و تحلیل قطعات (Fragment analysis)  انجام شد.نتایج: در مجموع 7 آلل و 21 ژنوتیپ ریزماهواره LEI0258 در دو جمعیت شناسایی شدند. بیشترین فراوانی متعلق به آلل 385 جفت باز (86/42 درصد) و کمترین فراوانی متعلق به آلل300 جفت باز (33/4 درصد) بود. همچنین هتروزیگوت ‌385/207 ژنوتیپ غالب در هر دو جمعیت بود. در تحلیل ماتریکس تشابه، 56/84 درصد تشابه بین دو جمعیت مشاهده شد.  نتیجه­گیری نهایی: نتایج حاصل از مطالعه حاضر سطح بالایی از هتروزیگوسیتی (71/85 و 35/91 درصد) و انحراف از تعادل هاردی-وینبرگ (0001/0P<) را در هر دو جمعیت جوجه‌های گوشتی راس 308 نشان داد. جمعیت‌های راس 308 در مقایسه با جمعیت‌های بومی از تنوع آللی کم و تشابه ژنتیکی بالایی برخوردارند. این نتایج اطلاعات بیشتری در جهت استفاده ازMHC  به عنوان یک نشانگر ژنی برای حفظ منابع و بهبود ژنتیکی در جمعیت جوجه‌های گوشتی فراهم می‌کند.