فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

فاکتور‌‌های رونویسی خانواده KNOX نقش مهمی در رشد و تکوین گیاه دارند. این فاکتورهای رونویسی در حفظ حالت تمایز نیافته سلول‌های مریستم راس ساقه نقش دارند. فاکتور رونویسی MtKNOX3،‌ در طی تکوین گره های تثبیت نیتروژن (نودول) در گیاه Medicago truncatula بیان می‌شود و همچنین می‌تواند روی فعال شدن بیان ژنهای بیوسنتز سیتوکینین موثر باشد. پروتئین‌های خانواده KNOX،‌ غالبا بصورت هومو و یا هترودایمر با فاکتورهای رونویسی BELL عمل میکنند. مطالعات اخیر نشان داد که فاکتور رونویسی MtBELL1-2 دارای بیان بالا در طی تکوین نودول در M. truncatula است و این فاکتور رونویسی می‌تواند با MtKNOX3 برهمکنش داشته باشد. هدف این مطالعه، شناسایی جایگاه‌های اتصال هومودایمر MtKNOX3-MtKNOX3 و هترودایمر MtKNOX3-MtBELL1-2‌ است. برای شناسایی جایگاه‌های اتصال از روش‌های مختلف بیوانفورماتیکی شامل روش‌های مبتنی بر توالی‌ پروتئین، روش‌های مبتنی بر سطح نسبی قابل دسترس پروتئین، روش‌های داکینگ، اسکن آلانین و شناسایی اسیدآمینه‌های محافظت شده، استفاده شده است. بر اساس نتایج بدست آمده، دومین MEINOX و هومئودومین در برهمکنش هترودایمر MtKNOX3-MtBELL1-2 نقش دارد، که با داده‌های قبلی در خصوص برهمکنش پروتئین‌های همولوگ آنها در گیاه آرابیدوپسیس مطابقت دارد. در خصوص همودایمر MtKNOX3-MtKNOX3 علاوه بر دومین‌های یاد شده، ناحیه ای در بالادست دومین MEINOX نیز حائز اهمیت می‌باشد.