تجزیه و تحلیل کل رونوشت RNA جهت شناساییRNA های غیر کد کننده تنظیمی و اهداف آنها در پاسخ به تنش خشکی در گندم (Triticum aestivum. L)

نویسندگان

1 دانش آموخته گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

2 مرکز تحقیقات گیاها ن دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی، کرج، ایران

3 استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

4 گروه ژنتیک، دانشکده علوم، دانشگاه دانش البرز، قزوین، ایران

5 مربی، گروه کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران

doi
10.22034/cmr.2025.8503.3305
چکیده

خشکسالی یکی از عوامل مهم تنش غیر زیستی است، که بر بهره وری محصولات زراعی از جمله گندم تأثیر می گذارد. با این حال، تحمل به خشکی یک ویژگی پیچیده است که شامل بسیاری از ژن ها و مسیرهای سلولی است. شناخت شبکه تنظیم مولکولی گندم در پاسخ به تنش خشکی از اهمیت بالایی در اصلاح مولکولی برخوردار است. RNA های غیر کدکننده با تنظیم بیان ژن بر رشد گیاه و مقاومت در برابر تنش های غیرزیستی تأثیر می گذارند. برای کمک به درک مکانیسم‌های تنظیمی پیچیده حاکم بر تحمل به خشکی در گندم، ما تجزیه و تحلیل کل توالی رونوشت RNA را در گونه‌ای گندم مقاوم به خشکی انجام دادیم. در مجموع 20462 mRNA و 209 miRNA با بیان متفاوت شناسایی گردید. از بین 20462 ژن با بیان متفاوت، 1025 به عنوان ژن های با توانایی مقاومت به تنش خشکی شناسایی گردیدند. ژن های هدف شناسایی شده توسط psRNATarget همگی در دسته بندی هستی شناسی ژن غنی شدند. تفاوت های قابل توجهی در تعداد ژن های هدف تنظیم شده توسط miRNA های با بیان متفاوت، به ویژه در انتقال سیگنال، پاسخ به تنش ها و مسیرهای آنتی اکسیدانی وجود دارد. نتایج ما مکانیسم‌های مولکولی تحمل به خشکی در گندم را روشن می‌کند و همچنین miRNA های پاسخ‌دهنده به خشکی و ژن های هدف آنها را شناسایی می‌کند. این نتایج می‌تواند برای بهبود گندم و گیاهان مرتبط مورد استفاده قرار گیرد، و اطلاعات مفیدی را به عنوان منابع ژنومی ارزشمند در اصلاح مولکولی گندم ارائه کند.