فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

آنزیم‌‌های لوسیفراز، آنزیم هایی هستند که در انتشار نور نقش دارند و به طور گسترده در زمینه بیوتکنولوژی صنعتی و پزشکی استفاده می شوند. ما قبلاً کلون سازی ژن لوسیفراز را از کرم شب تاب گونه ایرانی Luciola sp. گزارش کرده بودیم. با استفاده از روش‌های محاسباتی، لایه پنهان داده‌های ژنتیکی و ساختاری را در Luciola sp. تجزیه و تحلیل کردیم. برای این منظور با کمک نرم افزار ACUA، ENC و CBI مورد مطالعه قرار گرفت و محتوای AT1، GC1، AT2، GC2، AT3 و GC3 محاسبه شد. در ادامه از سرورهای UNAFold و Mfold برای پیش‌بینی تاخوردگی RNA استفاده شد. از روش ChExVis برای استخراج، ذخیره و آنالیز کانال های لوسیفراز استفاده شد. در نهایت، داکینگ سوبسترا توسط نرم افزار AutoDock Vina انجام شد. این تجزیه و تحلیل نشان می دهد که کدون های نادر Pro، Arg، Ile و Leu درتوالی این ژن وجود دارد. داکینگ 5'-O-[N-(Dehydroluciferyl)-sulfamoyl]-adenosine با لوسیفراز انجام شد و شبکه ای از میانکنش ها شناسایی شد. در پایگاه محاسباتی RNAfold، بهترین ساختار ثانویه دارای انرژی آزاد 70/397- کیلوکالری بر مول و انرژی آزاد ترمودینامیکی 28/427- کیلوکالری بر مول است. در این مطالعه، برخی اطلاعات بیولوژیکی پنهان از کد ژنتیکی شناسایی شد که ممکن است در فرایند فولدینگ و اتصال به سوبسترا نقش داشته باشند و نشان دهد که ترکیبات کدونی ممکن است در فولدینگ مناسب این آنزیم نقش داشته باشند.