شناسایی واریانتهای اللی ژن گیرنده ملاتونین((MTNR1A در جمعیتی از میش‌های نژاد افشاری

نویسندگان

1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، ایران

2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان

3 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، ایران

doi
10.22034/cmr.2023.2337
چکیده

در اکثر نژادهای گوسفند به‌ویژه نژادهای داخل ایران، تولیدمثل فصلی است. هورمون ملاتونین نقش مهمی در تولید‌مثل فصلی دارد در پژوهش حاضر، چند‌شکلی(های) موجود در اگزون شماره دو ژن MTNR1A در گوسفند افشاری در دو گروه نمونه‌های تصادفی (35 راس) و غیرفصلی (44 راس) بررسی شد. پس از استخراج DNA از نمونه خون دام‌ها و طراحی پرایمرهای اختصاصی جهت تکثیر قطعه مورد نظر (بخش انتهایی اینترون یک، کل اگزون شماره دو و بخش ابتدایی اینترون دو)، تکثیر این قطعه با دستگاه PCR انجام و شناسایی چند‌شکلی(های) موجود به کمک توالی‌یابی تعدادی از نمونه‌ها صورت گرفت. توالی‌ها در نرم‌افزارهای Chromas lite و ClC Main Workbench 5 بررسی شدند. یک چند‌شکلی در نوکلئوتید 408 از قطعه تکثیر شده (منطبق بر چندشکلیC519C>T از توالی cDNA) شناسایی شد. با تعیین ژنوتیپ‌ محصولات توالی یابی نشده به کمک RFLP، سه ژنوتیپ CC، CT و TT به ترتیب فراوانی‌های 78/0، 1/0، 11/0 شناسایی شدند. براساس نتایج حاصله، در کل داده‌ها، فراوانی آلل C وآلل T به‌ترتیب، 835/0 و 165/0 بود. ولی در گروهی که آبستنی غیر‌فصلی داشتند، آلل T فراوانی بیشتری داشت. همچنین، همبستگی مثبت و معنی‌داری بین ژنوتیپ و تولید‌مثل غیرفصلی مشاهده شد(r=0.36, p=0.0001) . بررسی نسبت Odds نیز نشان داد که احتمال وجود آلل T در این گروه 19 برابر بیشتر از گروه تصادفی می-باشد. لذا، احتمالا آلل T با غیر‌فصلی بودن تولید‌مثل این گوسفندان مرتبط است. با توجه به نتایج بدست‌آمده و در صورت تأیید نتایج فوق در مطالعات تکمیلی، از چند‌شکلی فوق می‌توان در جهت بهبود وضعیت تولید‌مثلی گوسفند استفاده نمود.