شبیه سازی دینامیک مولکولی آنزیم استیل کولین استراز در حضور نانوذرات طلا
نویسندگان
1 دانشگاه تهران دانشکده علوم و فناوری نوین
2 ایران، تهران، دانشگاه تهران، دانشکده علوم و فنون نوین، گروه مهندسی علوم زیستی
3 داتشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس
4 گروه مهندسی علوم زیستی- دانشکده علوم و فنون نوین-دانشگاه تهران
doi
چکیده
خواص ویژه نانوذرات و برهمکنش آنها با مولکول های زیستی توجه بسیاری از محققان را به خود جلب کرده است. هنگامی که نانوذرات طلا به بدن وارد میشوند، با مولکولهای زیستی مختلف مانند پروتئینها، لیپیدها، پلی ساکاریدها، و اسیدهای نوکلئیک مواجه میشوند. پروتئینهامیتوانند به راحتی به سطح نانوذرات طلا متصل شده و در اطراف نانوذرات طلا تشکیل یک پروتئین کرونا دهند. شکلگیری کرونا میتواند ساختار پروتئینهای جذب شده را تغییر دهد و در عملکرد فیزیولوژیک آنها اختلال ایجاد کند. بنابراین مطالعه برهمکنشهای نانوذرات طلا و پروتئینها میتواند نقطه آغاز مطالعات اثرات زیستی این نانوذرات محسوب شود. در این تحقیق، نظر به نقشهای کلیدی آنزیم استیلکولین استراز در سیستم عصبی و کاربردهای متعدد نانوذرات طلا در حوزههای مختلف، نحوه برهمکنش نانوذرات طلا با آنزیم استیلکولین استراز با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی مطالعه شده است. نتایج حاصل از بررسی ساختار دوم، RMSD و شعاع ژیراسیون نشاندهندهی القای فشردگی در ساختار پروتئین به واسطهی حضور نانوذرات طلا میباشد. همچنین، نتایج حاصل از آنالیزهای DSSP، نشانگر پایداری ساختار دوم آنزیم طی برهمکنش است. باتوجه به نتایج این تحقیق میتوان نتیجه گرفت نانوذرات طلا در مجاورت با آنزیم استیل کولین استراز، تغییرات کنفورماسیونی قابل توجهی در این پروتئین ایجاد نمی کنند.