شناسایی و مقدار سنجی نسبی تغییرات پروتئوم مبتنی بر اشک متاٌثر از بیماری قوز قرنیه
نویسندگان
1 بیوشیمی،علوم زیستی،تربیت مدرس،تهران،ایران
2 دانشگاه علوم پزشکی بقیه الله(عج)، تهران، ایران
3 گروه بیوشیمی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
doi
چکیده
قوز قرنیه حالتی نامتقارن از نازک شدن قرنیه است که بطور معمول در سنین نوجوانی بروز کرده و میزان شیوع آن حدود 1 نفر در هر 2000 نفر از جمعیت انسانی میباشد. به منظور آشکارسازی تغییرات فراوانی پروتئینهای نمونهی اشک میان دو گروه بیمار و شاهد، مقدارسنجی پپتیدهای حاصل از هضم پروتئولیتیکی پروتئینها، بدون نشاندار کردن آنها با استفاده از استراتژی الکتروفورز ژلی یک بعدی و کروماتوگرافی مایع-طیف سنجی جرمی متوالی انجام شد. نتایج حاصل از آنالیز آماری نشان داد که از میان 42 پروتئینی که بیان آنها بطور متمایزی متاٌثر از قوز قرنیه تغییر کرده بود، به ترتیب 28 و 14 پروتئین کاهش و افزایش سطح بیان نشان دادند. بر اساس نتایج حاصل شده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی مانند آنالیز هسته شناسی ژنی فرآیندهای زیستی که بطور عمدهای در اثر تغییرات سطح بیان این زیر مجموعه از پروتئینها در آسیب شناسی بیماری درگیر میشوند شامل: فرآیندهای سلولی ( % 1/27)، فرآیندهای متابولیکی (% 2/20)، تنظیم زیستی (% 6/11)، سازماندهی اجزای سلولی (%3/9) و پاسخ به محرکها (%3/9) هستند. همچنین آنالیز هسته شناسی ژنی مرتبط با موقعیت مکانی زیر مجموعهی پروتئینی مذکور حاکی از اختصاص گروه عمده ای از این پروتئینها به فضای داخل سلولی میباشد. این قبیل مطالعات پروتئومیک میتوانند به منظور ارتقای دانش پایهی ما از فرآیندهای زیستی و درک عمیقتر مکانیسمهای زمینهساز بیماریها و نیز در حیطهی تحقیقات بالینی در راستای شناسایی نشانگرهای زیستی بالقوهی بیماری و اهداف دارویی بسیار مفید واقع شوند.