همسانهسازی و بررسی فیلوژنتیکی توالیهای دو ژن متعلق به زیر خانواده کریپتوکروم DASH جلبک Volvox carteri
نویسندگان
1 گروه زیست شناسی گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
2 گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
3 گروه زیست شناسی گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
4 گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران
5 گروه زیست شناسی سلولی و تکوینی گیاهی، دانشگاه بیله فلد،بیله فلد، آلمان
6 مرکز تحقیقات علوم دارویی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران
doi
چکیده
در اکثر موجودات، گیرنده های نوری پیام رسانی به منظور درک و تفسیر علائم محیطی بهوجود آمدهاند. این مولکولها قادرند، نور را توسط کروموفورهای خود جذب کرده، مسیرهای پیام رسانی خاصی را در سلولها به راه انداخته و سبب بروز پاسخ مناسب در سلول شوند. شاخه جدیدی از علم به نام اپتوژنتیک تلاش میکند تا از گیرنده های نوری به عنوان ابزارهای مولکولی جهت کنترل دقیق وقایع سلولی استفاده کند. یکی از راههای توسعه اپتوژنتیک، شناسایی ابزارهای مولکولی جدید دارای خصوصیات ویژه می باشد. بدین منظور تعیین خصوصیات ژنهای پیش گویی شدهای که اورتولوگ گیرنده های نوری شناسایی شده می باشند، بسیار مفید خواهد بود. در پروژه تعیین توالی ژنوم Volvox carteri دو ژن پیشگوییشده متعلق به خانوادهی Cryptochrome/Photolyase شناسایی شد. هدف از این مطالعه، جداسازی توالیهای کدکنندهی این دو ژن، همسانهسازی دو ژن مذکور در داخل وکتور بیانی و تعیین موقعیت قالب خواندن باز آنها در خانواده کریپتوکروم/فتولیاز میباشد. بدین منظور، جلبک V.carteri تحت شرایط بهینه رشد داده شد. سپس با استفاده از تکنیک RT-PCR توالیهای کدکنندهی این دو ژن تکثیر شد. با استفاده از تکنیک مهندسی ژنتیک قطعات تکثیر شده وارد وکتور بیانی pGEX2TK گردید. به منظور همسانهسازی وکتور نوترکیب، پلاسمیدها وارد باکتری Escherichia coli گردیدند و سپس تعیین توالی شدند. نتیجه پژوهش نشان داد که توالیهای ثبتشده در پایگاه دادهای NCBI به عنوان توالی mRNA برای دو ژن کریپتوکروم DASH، با توالی آنها در ولوکس تفاوت هایی را نشان می دهد.
