روشی جدید برای تفکیک و طبقهبندی توالیهای سرطانی و غیرسرطانی DNA با استفاده از الگوریتمهای مبتنی بر LPC و SVD
نویسندگان
1
2
doi
چکیده
سرطان یکی از بیماریهایی است که روند رو به افزایش ابتلا به آن، محققان را به مطالعه ابعاد مختلف آن ترغیب میکند. منشا ژنتیکی سرطان، لزوم بررسی اجزای ژنی درونی سلول را نشان میدهد. در این مقاله سعی شده است تا با بهرهگیری از تکنیکهای تحلیل توالیهای DNA موجود، برخی مولفهها و ویژگیهای خاص ژنتیکی منحصر به فرد از توالیهای بزرگ DNA استخراج و آشکار شوند. شبیهسازی الگوریتم پیشنهادی روی توالیهای عضو خاصی از بدن انسان که از یک بانک اطلاعاتی معتبر تهیه شده است، انجام گرفته است. در الگوریتم ارائه شده از روش نگاشت منحنی Z برای تبدیل رشتههای DNA به سیگنال بهره گرفته شده است. روش پیشنهادی ارائه شده برای تحلیل سیگنالهای توالیهای DNA به منظور استخراج ویژگی، مبتنی بر الگوریتم پیشگوی خطی (LPC) است که از تکنیکهای محاسباتی ماتریس کواریانس و تجزیه مقدار منفرد (SVD) به منظور انتخاب ویژگی و کاهش ابعاد بهره میگیرد. با مقایسه برخی پارامترهای آماری، تفکیک و تمایز خوبی بین نمونههای سرطانی و غیرسرطانی مشاهده میشود که قابل طبقهبندی است. این سطح تمایز بیانگر مفهوم جهش بیولوژیکی و تغییرات ژنتیکی بیماری سرطان است.