شناسایی تنوع‌های آللی ژن های کمپلمان C4-A و لاکتوفرین با استفاده از فناوری iPLEX و ارتباط آن ها با تعداد سلول های بدنی شیر در گاوهای هلشتاین

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد فارغ التحصیل از دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

2 استاد، عضو هیئت علمی گروه علوم دامی - دانشکده علوم دامی وشیلات - دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

3 دانشیار، عضو هیئت علمی گروه علوم دامی- دانشکده علوم دامی و شیلات- دانشکاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری

doi
10.22059/jap.2021.309975.623559
چکیده

هدف از پژوهش حاضر شناسایی تنوع های آللی ژن های C4-A و لاکتوفرین و بررسی ارتباط آنها با تعداد سلول های بدنی شیر در گاوهای هلشتاین بود. بیماری ورم پستان یکی از شایع ترین بیماری های گاوهای شیری است که تولید شیر را کاهش می دهد و هزینه های زیادی را به پرورش دهندگان تحمیل می کند. ژن های C4-A و لاکتوفرین از جمله ژن های تاثیرگذار در سیستم ایمنی برای مقابله با پاتوژن ها عوامل میکروبی و بیماری ورم پستان محسوب می شوند. شماره 384 نمونه خون از گاو هلشتاین تهیه و استخراج DNA با استفاده از روش نمکی بهینه یافته انجام شد. برای تعیین ژنوتیپ نمونه ها از فناوری آیپلکس (IPLEX) استفاده شد. برای شناسایی چندشکلی های تک نوکلئوتیدی جایگاه های نشانگر 1- rs137485678; C<G و2-rs132741478; C<T برای ژن کمپلمان C4-A و جایگاه های 1- ; A<Grs384176726 و2- rs445918028; A<T برای ژن لاکتوفرین انتخاب شدند. تعیین ژنوتیپ در جایگاه rs137485678; C<G از ژن C4-A دو آلل C و G با فراوانی های 0/58 و 0/42 و همچنین سه ژنوتیپ CC,CGو GG به ترتیب با فراوانی 0/31،0/53 و 0/16 را نشان داد. در سایر جایگاه ها چندشکلی مشاهده نشد. تجزیه و تحلیل نشانگر-صفت وجود ارتلباط معنی دار آماری (P<0/05) را نشان داد. به صورتی که گاوهای با ژنوتیپ CG کمترین تعداد سلول های بدنی را داشتند. برای شناسایی هاپلوتایپ از نرم افزار فاز (phase) استقفاده شد. براساس نتایج ای نتحقیق ناشنگر 1- rs137485678; C<G از ژ« C4-A می تواند به عنوان نشانگر ژنتیکی برای بهبود ورم پستان در گاوهای شیری مورد استفاده قرا گیرد.