شناسایی شبکه تنظیمی عمکردی miRNA-mRNA در سقط مکرر: آنالیز بیوانفورماتیکی پرزهای جفتی انسانی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

2 دانشیار، گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران.

doi
10.22038/ijogi.2025.82344.6191
چکیده

مقدمه: سقط خود‌به‌خودی مکرر (RSA)، یک اختلال تولیدمثلی است که مسئله حل نشده‌ای را در زنان ایجاد می‌کند. miRNAها ممکن است در تنظیم رشد جنین و حفظ بارداری نقش داشته باشند. مطالعه حاضر با هدف بررسی پروفایل miRNA در پرز جفتی زنان با سقط مکرر با مطالعات بیوانفورماتیکی انجام شد. روش‌کار: در این مطالعه، پروفایل بیانی mRNA و miRNA سلول‌های پرز جفتی از پایگاه GEO دریافت شدند. بعد از به‌دست آوردن هدف‌های miRNAهای دارای تغییر بیان، اشتراک این هدف ­ها با mRNAهای کاهشی/افزایشی به‌دست آمد. در مرحله بعد هویت‌شناسی ژنی (GO) و مسیرهای KEGG، برای ژن ­های مشترک انجام شد. شبکه میانکنش پروتئین- پروتئین و ژن­ های کلیدی مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت شبکه تنظیمی miRNA-mRNA رسم شد. یافته ­ها: تعداد 123 miRNA با تغییر بیان (16 عدد کاهش بیان و 107 عدد افزایش بیان) و 670 ژن با تغییر بیان (شامل 269 ژن کاهش بیان و 366 ژن با افزایش بیان) آنالیز شدند. بعد از ایجاد اشتراک میان هدف‌های miRNAها و ژن‌های با تغییر بیان، 219 ژن مشترک به‌دست آمد. نتایج آنالیز KEGG و GO نشان داد که ژن‌ها در مسیرهای پرولاکتین، اکسی‌توسین، تولید اینترلوکین 6 و تمایز لوکوسیتی نقش دارند. همچنین در شبکه miRNA-mRNA ترسیم شده، miR-548ap-5p و miR-320b با بیشترین امتیاز مشخص شدند. نتیجه ­گیری: مطالعه حاضر miRNA­ها و mRNAهای دارای تغییر بیان و  همچنین ژن‌های کلیدی در سلول­ های پرز جفتی با RSA را شناسایی کرد. این مطالعه می‌تواند مارکرهای زیستی جدیدی را برای تشخیص یا درمان احتمالی RSA پیشنهاد کند.